Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 2,825,796 | Δ4,947 bp | srlA–[gutQ] | srlA, srlE, srlB, srlD, gutM, srlR, [gutQ] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 2825796 | 2830742 | 4947 | 62 [0] | [0] 62 | srlA–[gutQ] | srlA,srlE,srlB,srlD,gutM,srlR,[gutQ] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2825795 | 0 (0.000) | 62 (0.410) | 55/488 | 0.9 | 100% | intergenic (‑219/‑37) | mltB/srlA | membrane‑bound lytic murein transglycosylase B/sorbitol‑specific PTS enzyme IIC2 component |
? | NC_000913 | 2830743 = | 0 (0.000) | coding (931/966 nt) | gutQ | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase GutQ |
CAATGTTACATAACGACGCTTGAACATGAGGGGTCCATTTAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGTAGTCACTGCCCGATACGGACTTTACATAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATATTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2825550‑2825795 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2:215618/1‑179 CGCACAAGGAAGCGGTAGTCACTGCCCGATACGGACTTTACATAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATATTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTC < 1:215618/179‑1 agaCACTGCCCGATTCGGCCTTTACCTAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATATTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCAAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGCCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGC > 2:1017502/4‑251 ACTGCCCGATACGGACTTTACATAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATATTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGC < 1:860429/251‑1 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CTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTC > 2:451110/1‑251 TTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGG > 2:732615/1‑251 CAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCc > 2:551730/1‑250 gattagagtggtTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTAACAGGCGGGGATTTTTTAACCCTTAAACCCCAGCCGTTTCCCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGGGCCAGTGCCTGACAAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGC < 2:760222/232‑1 GATTAGATTAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGC > 1:760222/1‑244 AGATTAGGGTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTC < 1:125440/251‑1 ATTAGGTTGCCGTAAACTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGCCGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTC > 2:843530/1‑249 TAGGTTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTCAGG > 2:843890/1‑250 gGGTTGCCATAACCTGCAGAATTTCAATCAGGCCGGGTTTATTTAATCCTCCAACCCCAGAGTTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCACCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTGCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCTCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTCAGGAA < 2:997509/250‑1 TTGCCGTAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTCAGGAAA > 1:91407/1‑249 TAACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTCAGGAAAAGCAAAAT > 1:653471/1‑251 CAATGTTACATAACGACGCTTGAACATGAGGGGTCCATTTAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGTAGTCACTGCCCGATACGGACTTTACATAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATATTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAGGTTGCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2825550‑2825795 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACCTGCAGGATTTCTATCAGGCCGGGATTATTTAATCCTTCAATCCCAGACGTTTCGCCAGCCGATGCAGGTTGGCGACGTCGGTTTCCAGCATCCGCGCGCAGGCAGCCCAGTTGTGATGATTTTGTGCCAGTGCCTGACGAATAGTTTCACGCTGGAACGCTTCTGTCGCTTCACGCAGGTTTTGCTTAACAACGGGCACCGCCGCCACTTCTGGCGTCGGCAACGTCACCTCAGGAAAAGCAAAAT > NC_000913/2830743‑2830992 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |