| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 105 [0] | [0] 104 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 104 (0.680) | 93/488 | 0.2 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
| ? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2030203‑2030450‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGC > NC_000913/2041379‑2041619 GTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCCAAACCCGTAGATGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACG > 1:684751/1‑250 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CCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACG < 1:116600/238‑1 CAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAAC < 2:1076077/250‑1 AACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCGCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTG > 1:205044/1‑251 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AATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCCCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGT < 2:673331/251‑1 CCGTAATGTCGGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCT < 2:401819/250‑1 CCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTT > 1:119287/1‑251 GTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTT > 1:570771/1‑250 AATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATT < 1:260473/251‑1 ATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTG > 1:863522/1‑251 GTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGTTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGT < 2:969077/250‑1 CAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTA < 1:329463/250‑1 AGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTT < 2:107142/212‑1 AGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTT > 1:107142/1‑212 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NC_000913/2030203‑2030450‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGC > NC_000913/2041379‑2041619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |