| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 53 [0] | [0] 53 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 53 (0.900) | 49/494 | 0.1 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
| ? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT | |||||
AAAGTACGCGTTATCCCTGCCGGATGTGGCGCGAGCGCCCTATCCGGCATACACAGATCGCATCAGGTTATGTTTCGTTTGTCATCAACCTCAAATCACCAAAATAATTTATTTTATTTCAATAAGATAGATAAGTAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGCAGA > NC_000913/2041134‑2041628 | cgattatcgccatcaacgcttatatgtatttaatccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTc < 1:115381‑M2/6‑1 (MQ=255) gattatcgccatcaacgcttatatgtatttaatccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCg > 2:100785‑M2/245‑251 (MQ=255) tcaacgcatatatgtctttcatccgtaatgtaagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggcctgggtggagacacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtacttgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaactatatcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTAGTCTTTacaagc > 2:110353‑M2/234‑249 (MQ=255) cgcttatatgtatttaatccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGc < 1:326574‑M2/22‑1 (MQ=255) atgtatttaatccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgtcaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcggaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCt > 2:287831‑M2/223‑251 (MQ=255) atgtatttaatccgtaatggcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccggagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAATCTGGCTGTTGc < 2:396324‑M2/28‑1 (MQ=255) gtatttaatccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGCCTTTACAAACTGGCTGTTGCtt < 2:7659‑M2/30‑1 (MQ=255) gccgtaatggcaggccggctctcgccaccagctacgcttaggttaacccggtggtcgcggtcttgctggggacgggactgggtggagaaactctgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacggtgggaaaatagctcgtcccggtaaaacccgtagttgcgccagttattcagtacgcatcaCGATTCGTTTTTACAAACTGGCTTTTGCTTTAGGTGTCt < 1:396505‑M2/39‑1 (MQ=255) ccgtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCtt > 2:16297‑M2/212‑251 (MQ=255) gtaatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGGGTCttt > 2:304396‑M2/210‑250 (MQ=255) aatgtcagtccggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggaaaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctctgcgtaattgtcttcgcggtggtactggtgacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcagtacgcatcaCGATTCTTCTGTACAAGCTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTAt < 1:332215‑M2/43‑1 (MQ=255) ggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTcc > 1:199419‑M2/197‑251 (MQ=255) ggctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGCGTCTTTATTGTTAGCGCTcc > 2:123985‑M2/197‑251 (MQ=255) gctctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCt > 1:148556‑M2/196‑251 (MQ=255) ctcgccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGcc > 1:403758‑M2/193‑251 (MQ=255) gccaccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCttt < 2:148556‑M2/62‑1 (MQ=255) caccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTc < 1:414668‑M2/64‑1 (MQ=255) cccagctacgcttacgttaacccggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCg < 1:88387‑M2/65‑1 (MQ=255) cggtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCa < 1:100785‑M2/87‑1 (MQ=255) gtggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCa > 1:247182‑M2/163‑249 (MQ=255) ggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAGCACTCACACggcaagcc < 1:89906‑M2/91‑4 (MQ=255) ggtcgcggtcttgctgggtacgggactgggaggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACggcaagcc > 2:453007‑M2/161‑248 (MQ=255) gcggtcttgctggggacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcccgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcctcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCtt > 2:327219‑M2/157‑250 (MQ=255) tgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgcatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGATGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAgg > 2:339170‑M2/150‑251 (MQ=255) gctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGt < 2:403758‑M2/103‑1 (MQ=255) tacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAAc > 2:380313‑M2/143‑250 (MQ=255) gggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACaaaa < 2:419691‑M2/112‑1 (MQ=255) ggagaaacacggtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAAt < 2:16143‑M2/122‑1 (MQ=255) aacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTg > 2:36201‑M2/125‑181 (MQ=255) aacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTg < 1:36201‑M2/57‑1 (MQ=255) attgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtaacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGGGTCTTTATTGTTAGCGCTACTGCCTTTTCGAATGGGCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGCACAAAAAGATGCTAATGGTGTTTTtgatgatgac > 2:228746‑M2/112‑249 (MQ=255) tgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTttgatgatgtca > 2:247259‑M2/110‑247 (MQ=255) 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gcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGt < 1:22205‑M2/226‑1 (MQ=255) gccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCtt > 1:280236‑M2/23‑251 (MQ=255) tattcaggactcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCaga < 2:266300‑M2/234‑1 (MQ=255) ttcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCaga > 2:191097‑M2/15‑248 (MQ=255) gacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCg > 1:43787‑M2/10‑251 (MQ=255) aCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGCAGa < 1:16297‑M2/250‑1 (MQ=255) | AAAGTACGCGTTATCCCTGCCGGATGTGGCGCGAGCGCCCTATCCGGCATACACAGATCGCATCAGGTTATGTTTCGTTTGTCATCAACCTCAAATCACCAAAATAATTTATTTTATTTCAATAAGATAGATAAGTAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGCAGA > NC_000913/2041134‑2041628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |