| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,411,645 | 9722 bp→A | yhdJ–[yhdY] | yhdJ, yhdU, envR, acrE, acrF, yhdV, yhdX, [yhdY] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3411645 | 3421366 | 9722 | 44 [0] | [0] 43 | yhdJ–[yhdY] | yhdJ,yhdU,envR,acrE,acrF,yhdV,yhdX,[yhdY] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3411644 | 0 (0.000) | 43 (0.730) +A |
39/492 | 0.3 | 100% | intergenic (+77/‑9) | fis/yhdJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Fis/DNA adenine methyltransferase |
| ? | NC_000913 | 3421367 = | 0 (0.000) | coding (43/1104 nt) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY | |||||
CTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGG > NC_000913/3411394‑3411891 | cTGAATGGTCAGGATGTGAATGAACTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAAACAGACCCGTGATGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGAGAAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGATTGATTAAAAAAGCGCTACTCGGCATGGGGCAGCGCCTTTTTTATAGTTGTTACAAAgg > 1:46226/1‑251 (MQ=255) aggttaatgacaTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAAGCCACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATGAACCGTGGTACGTTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAAGGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATTGGGAAGCGTCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacattacttaagc < 2:42607‑M1/246‑14 (MQ=255) gagtgacCTATATGAGCTGGTACTGGCTGAAGGAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTAAGGTTAGCTAAATGCTTGTTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcg > 2:351771‑M1/4‑234 (MQ=255) ctATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGAACCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCGTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggt < 2:146404‑M1/249‑25 (MQ=255) tGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgt > 1:229619‑M1/1‑207 (MQ=255) aGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctcc < 2:411659‑M1/250‑50 (MQ=255) cAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctg > 1:340167‑M1/1‑197 (MQ=255) aTGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgct > 1:255746‑M1/1‑182 (MQ=255) acacCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatatcctgctgactattggctg < 2:171227‑M1/250‑82 (MQ=255) ccGTGGTAACCAGACACGTGATGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGATGTGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCAAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtttgggtgcgaaaaaatctggtctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatct > 2:158217‑M1/1‑165 (MQ=255) cGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatg > 2:76904‑M1/1‑164 (MQ=255) aaCCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttga < 1:338054‑M1/250‑93 (MQ=255) ccGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaac > 1:410954‑M1/1‑150 (MQ=255) gctgcGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactga < 2:421105‑M1/250‑105 (MQ=255) gcgcTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcc < 1:375736‑M1/250‑108 (MQ=255) atgGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgct > 1:221914‑M1/1‑134 (MQ=255) gCATCAACCGTGATACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAACTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAACGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggtggatgtgggaactgatcccaccgttgctgaac < 1:223588‑M1/251‑122 (MQ=255) aTCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATGCCGGCTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgctcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgagctg < 1:197847‑M1/251‑124 (MQ=255) gTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttg > 1:255736‑M1/1‑118 (MQ=255) tACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGATTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattgactgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgc > 2:248403‑M1/1‑117 (MQ=255) cTGCGTACAAAATTGAAAAAATACGGCATGGACTATTTCAGGTTAGCTAAATGATTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATCGGTGTCACAAAGGaaataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttatccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcctatggttgatgtgggaactggtcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggg > 2:143582‑M1/1‑113 (MQ=255) gTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaac > 2:383203‑M1/1‑109 (MQ=255) tAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaact > 1:186466‑M1/1‑108 (MQ=255) aaaaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactggg > 1:93108‑M1/1‑105 (MQ=255) gAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggct > 1:440576‑M1/1‑99 (MQ=255) gAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggct > 1:325795‑M1/1‑99 (MQ=255) aCGGCATGAAATAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGAATGGGGAAGAGCCTTTTTTATAGGTGTCACACAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgctcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgt > 2:140351‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccg > 2:191737‑M1/1‑86 (MQ=255) gAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgact < 2:282796‑M1/251‑168 (MQ=255) aaCTAAGTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGTGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaagctaactgggttggctcaacgcgtgccgactg < 2:45717‑M1/251‑169 (MQ=255) gTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTAGAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccg < 2:245625‑M1/251‑180 (MQ=255) tacctaaATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgagcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcatgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgcggaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaccgcgtgccgaatgcacaaaagccggt > 2:285330‑M1/4‑70 (MQ=255) tAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggt > 1:401070‑M1/1‑70 (MQ=255) aGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggt < 2:287433‑M1/250‑182 (MQ=255) aaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgt > 1:381732‑M1/1‑64 (MQ=255) aaGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgagcgatggtgtgggtgcgaaaaaagctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttat < 2:272582‑M1/251‑223 (MQ=255) gcgcCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgt < 2:325795‑M1/251‑225 (MQ=255) cgcCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgta < 1:158063‑M1/251‑226 (MQ=255) ccTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatg < 1:159019‑M1/251‑228 (MQ=255) ccTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatg < 2:27702‑M1/251‑228 (MQ=255) ttttATAGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatgggct > 2:408942‑M1/1‑20 (MQ=255) taGGTGTCACAAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaaagcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatgggctttacc > 1:213441‑M1/1‑15 (MQ=255) acaAAGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatgggctttacccacacgac < 1:76904‑M1/251‑245 (MQ=255) aaGGacataacttaagccgcgcgatggtgtgggtgcgaaaaaatctgttctccagctggagcaatagcctgctgactattggctgcatatggttgatgtgggaactgatcccaccgttgctgaactgggcatttttgcaggctaactgggttggctcaacgcgtgccgactgcacaaaagccggtgcctgttgggtcttcatccacgaacgatttggtcagtttatgtatgggctttacccacacgaccaa < 2:93108‑M1/251‑248 (MQ=255) | CTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGG > NC_000913/3411394‑3411891 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |