Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,060,444 | Δ19,761 bp | yihL–yiiF | 19 genes yihL, yihM, yihN, ompL, yihO, yihP, yihQ, yihR, yihS, yihT, yihU, yihV, csqR, yihX, yihY, dtd, fabY, yiiE, yiiF |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4060444 | 4080204 | 19761 | 58 [0] | [0] 58 | yihL–yiiF | yihL,yihM,yihN,ompL,yihO,yihP,yihQ,yihR,yihS,yihT,yihU,yihV,csqR,yihX,yihY,dtd,fabY,yiiE,yiiF |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4060443 | 0 (0.000) | 58 (0.950) | 50/492 | 0.1 | 100% | intergenic (+213/‑4) | bipA/yihL | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA/putative DNA‑binding transcriptional regulator YihL |
? | NC_000913 | 4080205 = | 0 (0.000) | intergenic (+236/+94) | yiiF/fdhE | protein YiiF/formate dehydrogenase formation protein |
CCGCGCCAACCGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAACAATGGCGGAGAATCAATCCACCGTAGAAAATGCAAAAGAGAAACTGGATCGGTGGTTGAAAGATGGCATCACCACGCCGGGTGGAAAACTCCCTTCAGAAAGAGAGCTGGGAGAACTGCTGGGCATTAAACGTATGACGCTGCGCCAGGCGTTGTTGAACCTCGAGGCAGAATCCAAAATCTTCCGTAAGGATCGTAAGGGGTGGTTCGTGACCCAGCCGCGATTTAATTACAGTCCGGAGCTGTCG > NC_000913/4060200‑4060692 | ccgcGCCAACCGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGGTTTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttg > 1:186356‑M1/1‑245 (MQ=255) ccGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacg < 1:371819‑M1/251‑17 (MQ=255) ccGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacg > 1:217457‑M1/1‑235 (MQ=255) ctcaagacGATTAATTTCTTTTTTTAGTCATAAAAACCCAGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTTAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTGTGTCACACTTATCTGCAAAGTCAGTCGGCGTTAATTGCTTTCGTGTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTGTAAACCAAAAGGATTAAgcttcaggtggtaacggtgaat < 2:428676‑M1/246‑23 (MQ=255) gAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGAGTAAgcttgatgtggtaacgcggaatacg < 2:365435‑M1/251‑26 (MQ=255) gAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCGTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacg < 2:505611‑M1/251‑26 (MQ=255) aTTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatgg > 2:432819‑M1/1‑218 (MQ=255) tAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtg > 1:198059‑M1/1‑216 (MQ=255) cGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtca < 2:106606‑M1/251‑42 (MQ=255) tCATAAAAAACATGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatg > 2:479667‑M1/1‑200 (MQ=255) ttttttttGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccaccc < 2:418908‑M1/250‑80 (MQ=255) ttttGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAATCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaa > 1:496278‑M1/1‑167 (MQ=255) ttGCCTGTCGGGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaa < 2:175633‑M1/250‑86 (MQ=255) gTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggagtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcag > 2:463792‑M1/1‑156 (MQ=255) gAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagatt > 1:245365‑M1/1‑154 (MQ=255) gAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagatt > 2:34436‑M1/1‑154 (MQ=255) aGCGCACACCTATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattac < 2:331290‑M1/251‑99 (MQ=255) gCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcaccc < 2:198059‑M1/250‑111 (MQ=255) cGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTACAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctcctgcacccgg < 1:299406‑M1/251‑113 (MQ=255) gAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccgg > 1:419443‑M1/1‑138 (MQ=255) gAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccgg > 1:70270‑M1/1‑138 (MQ=255) aGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaa < 1:359397‑M1/251‑115 (MQ=255) gTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgat > 1:79937‑M1/1‑121 (MQ=255) gTCAATAGAGATGTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcggcctgcgccacccggaaaacgtcagagatgactctccttcacccggaaacaggaacgtgttgatggaactgcgggc < 2:137957‑M1/251‑143 (MQ=255) agagagCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagcc > 1:505493‑M1/1‑103 (MQ=255) agagagCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagcc < 1:123509‑M1/251‑149 (MQ=255) gagCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttc < 1:194358‑M1/251‑152 (MQ=255) agCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagcgattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttct > 1:193305‑M1/1‑99 (MQ=255) gCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttctt > 2:462390‑M1/1‑98 (MQ=255) cTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttg > 2:117497‑M1/1‑97 (MQ=255) ttGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgc < 1:52549‑M1/250‑156 (MQ=255) aTCTGCAAAGTAATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcg > 2:35534‑M1/1‑84 (MQ=255) tCTGCAAAGACATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagcctacttgctccattcgtgcgt > 2:39531‑M1/1‑83 (MQ=255) gCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtc < 2:186356‑M1/249‑170 (MQ=255) cATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtacc > 2:286864‑M1/1‑73 (MQ=255) cATACGACGTTACTTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaccgggttgaaggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtacc > 2:142625‑M1/1‑73 (MQ=255) aTTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATTCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtc < 2:70270‑M1/251‑191 (MQ=255) ttGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatcgccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtc > 2:292463‑M1/1‑60 (MQ=255) tGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggattacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcat > 1:417348‑M1/1‑59 (MQ=255) ttctttTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctg < 1:289811‑M1/250‑196 (MQ=255) ttttGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgc > 2:65035‑M1/1‑50 (MQ=255) ttttGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgc < 1:65035‑M1/216‑167 (MQ=255) ggCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAACCCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttc > 1:324235‑M1/1‑46 (MQ=255) aagcgtaagATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgaccggcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaccgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctaccgcttcgcttt > 2:32053‑M1/1‑41 (MQ=255) gcgtaagATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagataggcgaggtcatctgctacggcttcgattttt < 2:341487‑M1/251‑213 (MQ=255) gcgtaagATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgattttt < 1:34436‑M1/251‑213 (MQ=255) aagATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggat < 2:506829‑M1/251‑217 (MQ=255) agATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatc < 2:79937‑M1/251‑218 (MQ=255) gCTTCATCTGGTTTAAACCAACAGGATTAAgcttgaggtgggaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgtgcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggacacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgagtccatctgctccggcttcgatttttggatctttt > 2:58‑M1/1‑30 (MQ=255) gCTTCATCTGGATTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgtggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttt > 2:287742‑M1/1‑30 (MQ=255) cTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgctttttggatctttttcctgat > 1:298566‑M1/1‑23 (MQ=255) cTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttttcctgat > 1:217543‑M1/1‑23 (MQ=255) ggTTTAAACCAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagagtactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttttcctgat < 2:55768‑M1/249‑229 (MQ=255) gTTTAAACCAAAAGGATTAAccttgaggaggtaacgcggaatacgagagatgctgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacagtaacgggttgatggaactgctggcctagccttcttgctccattcctgcgtccagtaccagagaggcgagttcatctgctacggcttcgattttttgatatttttcctgatagc > 2:140185‑M1/1‑20 (MQ=255) ccAAAAGGATTAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttttcctgatagagaatttt < 1:292463‑M1/251‑239 (MQ=255) aGGATTAAgcgtgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgccctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttttcctgatagagaattttcaggt < 2:316490‑M1/251‑244 (MQ=255) tAAgcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatatgctacggcttcgatttttggatctttttcctgctagagaattttccggtaagtg > 2:146670‑M1/1‑3 (MQ=255) aagcttgaggtggtaacgcggaatacgagagatggtgtcgtcacaccctatgagctgtaatccgggcgacctgcgccacccggaaaacgtcagagattactctccttcacccggaaacaggaacgggttgatggaactgcgggcatagccttcttgctccattcgtgcgtccagtaccagagaggcgaggtcatctgctacggcttcgatttttggatctttttcctgatagagaattttcaggtaagtgt > 1:434015‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCGCGCCAACCGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCCAGCGATGGCAGG‑TTTTTTTTTGCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAACAATGGCGGAGAATCAATCCACCGTAGAAAATGCAAAAGAGAAACTGGATCGGTGGTTGAAAGATGGCATCACCACGCCGGGTGGAAAACTCCCTTCAGAAAGAGAGCTGGGAGAACTGCTGGGCATTAAACGTATGACGCTGCGCCAGGCGTTGTTGAACCTCGAGGCAGAATCCAAAATCTTCCGTAAGGATCGTAAGGGGTGGTTCGTGACCCAGCCGCGATTTAATTACAGTCCGGAGCTGTCG > NC_000913/4060200‑4060692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |