| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 63 [0] | [0] 63 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 63 (1.030) | 55/492 | 0.1 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
TAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTAC > NC_000913/3866090‑3866567 | cacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTg < 1:277889‑M2/12‑1 (MQ=255) ccggctggcggtcttgtcgtggttctgcaaaacattggttccgggttgctggcgtcgtgctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgtggatgaccttaatgggattgttgatcgggctgtgctggcggccgctggcgacgcggatgtcgcatcagtggctgcccgtttaagcgcatgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaactatgctgcttGAAGCAGATTTGc < 2:447578‑M2/13‑1 (MQ=255) acggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGc < 1:1171‑M2/13‑1 (MQ=255) gctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCtt > 1:278739‑M2/236‑251 (MQ=255) ggcgcgcgggtcggcggtctgtaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTtat < 2:273336‑M2/18‑1 (MQ=255) ggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGcac < 1:416864‑M2/25‑1 (MQ=255) gtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACAtt > 1:162242‑M2/224‑251 (MQ=255) 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gggcaccgcagcatcggcatcagctccatgggagaacgatgatgcttGAAGCAGAATTGCCTGATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTATCGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGTCGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCa < 2:4314‑M2/204‑1 (MQ=255) cgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGa < 1:145576‑M2/210‑1 (MQ=255) catcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGGAAAAAGAATAGATAGTTAGCTACTTAACGCGGGGAGGTCGGTGATAGCGATAAACCGCGCTGCGG‑ATGGG‑TCAGGCTCATTTCAAATTa > 1:74497‑M2/37‑250 (MQ=255) atcgtcatccgctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTCTAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGACATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGCC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAAAAGGCAGGTTGCTATTTAACGCGGGCCGTTCGCTGATAGCGATAACCTGCGCCGC‑GCAGGGGTT‑AGGCTCCTTACGaattta > 1:90892‑M2/36‑248 (MQ=255) atcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAATTAACTATTTAACACGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAAATaa > 1:459129‑M2/36‑250 (MQ=255) gtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCTAAGAAAATAGATAGTTAGATATTTAACGCGGGGCGTTCGCTGATAGAGATACGCTTCGCCGC‑C‑ATGGGTTCAGGGTCATTACCAATTAAATc > 2:204507‑M2/33‑250 (MQ=255) catcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAat < 1:279544‑M2/221‑1 (MQ=255) ccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGt < 2:210681‑M2/228‑1 (MQ=255) ccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTa < 1:49622‑M2/229‑1 (MQ=255) gaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGttt > 1:106333‑M2/15‑251 (MQ=255) acgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCCGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTAc > 1:426414‑M2/13‑251 (MQ=255) | TAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGAC‑AAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGC‑G‑ATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTAC > NC_000913/3866090‑3866567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |