| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,417,058 | Δ10,734 bp | yfcC–[argT] | yfcC, yfcD, yfcE, yfcF, yfcG, folX, yfcH, rpnB, hisP, hisM, hisQ, hisJ, [argT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2417058 | 2427791 | 10734 | 53 [0] | [1] 55 | yfcC–[argT] | yfcC,yfcD,yfcE,yfcF,yfcG,folX,yfcH,rpnB,hisP,hisM,hisQ,hisJ,[argT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2417057 | 0 (0.000) | 53 (0.870) | 46/492 | 0.2 | 100% | intergenic (+166/‑24) | pta/yfcC | phosphate acetyltransferase/putative transporter YfcC |
| ? | NC_000913 | 2427792 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+265) | argT/ubiX | lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein/flavin prenyltransferase | |||||
AGTGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGAAACA > NC_000913/2427550‑2428042 | gtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAAccc < 1:251842‑M2/9‑1 (MQ=255)gtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacacaatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAAccc > 1:83760‑M2/243‑251 (MQ=255)gtcccgtggcgcactggttgacgatagcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAAcc < 2:400044‑M2/8‑1 (MQ=255) cccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTc < 2:225468‑M2/11‑1 (MQ=255) gtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACACTCa > 1:141206‑M2/238‑249 (MQ=255) atcggctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTAtgt > 1:134656‑M2/218‑251 (MQ=255) tacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTgtgt > 1:484339‑M2/212‑250 (MQ=255) atcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatctcgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTAttgtgt < 1:378085‑M2/46‑1 (MQ=255) cgcgctgactgcgattcaggctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgcttcggatatatgaaccggaaataatctctatttccggttttttatgctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTAttgtgttg < 2:204866‑M2/48‑1 (MQ=255) gactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGtt > 1:278653‑M2/198‑251 (MQ=255) 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1:505916‑M2/121‑133 (MQ=255) ataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCaa < 2:505916‑M2/13‑1 (MQ=255) atcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTg < 1:505660‑M2/134‑1 (MQ=255) ttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCattatt < 1:404644‑M2/141‑1 (MQ=255) 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cccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAAtt < 1:74598‑M2/240‑1 (MQ=255) ttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAAGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCGTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCTAGGAGTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCt < 2:83760‑M2/245‑1 (MQ=255) tctacataACCTACAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGCGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCAATCTTGACGATAACAGTAAAATTTCACGTTAAATATGTTACTAAGACGCTGCATTATTGTGCTGCAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCAGTTGAATCGCATCGTTTCGATTGAATTGTAGAAACAAATTGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTgc > 2:107781/3‑249 (MQ=255) acataACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGAAACa < 1:261582/251‑1 (MQ=255) | AGTGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGAAACA > NC_000913/2427550‑2428042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |