| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,961,950 | Δ28,129 bp | yecT–[tyrP] | 33 genes yecT, flhE, flhA, flhB, cheZ, cheY, cheB, cheR, tap, tar, cheW, cheA, cheA, motB, motA, motR, flhC, flhD, insB5, insA5, uspC, otsA, otsB, araH, araG, araF, ftnB, yecJ, azuC, yecR, ftnA, yecH, [tyrP] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1961950 | 1990078 | 28129 | 53 [0] | [0] 52 | yecT–[tyrP] | yecT,flhE,flhA,flhB,cheZ,cheY,cheB,cheR,tap,tar,cheW,cheA,cheA,motB,motA,motR,flhC,flhD,insB5,insA5,uspC,otsA,otsB,araH,araG,araF,ftnB,yecJ,azuC,yecR,ftnA,yecH,[tyrP] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1961949 | 0 (0.000) | 52 (0.850) | 43/492 | 0.2 | 100% | intergenic (‑68/‑23) | yecV/yecT | protein YecV/protein YecT |
| ? | NC_000913 | 1990079 = | 0 (0.000) | coding (399/1212 nt) | tyrP | tyrosine:H(+) symporter | |||||
GCTATTACTGCTGGAGGTGTACCAGCATGTTCCGGCAGATACCGGTCTGGGCACGCTGGCAAAACGCTATCTGGGACGCTACGGTCAATGGCTGACGGGCTTCAGTATGATGTTCTTAATGTATGCTCTGACTGCGGCATACATCAGCGGTGCCGGTGAATTGTTGGCCTCCAGCATCAGCGACTGGACAGGTATTTCTATGTCGGCAACCGCTGGCGTGCTGTTGTTCACTTTTGTTGCCGGTGGCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCT > NC_000913/1989833‑1990326 | gtaacagccgtctcaaactggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTgg > 1:143098‑M2/247‑251 (MQ=255) ggtcagaaacgggcaacactgacggcgaagacgctgaagttgggtcgggattcgtggggtatggagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagggaagccttatcagtgttggccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaagggacatgccattgttttctcactgttggataagaggctagaagcgtaatatccggccctagggaaacgataacgCGTGGATTGTGTc < 2:162377‑M2/13‑1 (MQ=255) cgtctaaaactgtgataactgacggcgaagagggtgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaagcgatttttcgtgggagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggctagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTc < 2:101856‑M2/13‑1 (MQ=255) aaaactggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCgg < 1:470098‑M2/15‑1 (MQ=255) aaaacgggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCgg < 2:289834‑M2/15‑1 (MQ=255) aaactggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattcggaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACt < 2:477253‑M2/19‑1 (MQ=255) actggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTc < 1:365730‑M2/21‑1 (MQ=255) ctggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTc > 1:186397‑M2/230‑250 (MQ=255) tggcacaactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCAc > 1:210219‑M2/229‑251 (MQ=255) gtcccaactgacgtcgaagacgctgaagctgggtcttgatacgctgggtattaagactttagagggtatgaaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggctttttttttgccatctaaatgtattcttaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCaca < 2:269743‑M2/24‑2 (MQ=255) agacctggaggggaagaggctgaagctgggtctggatacgctgggtattgggactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgctcagggttatccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaagggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGt < 2:228169‑M2/27‑1 (MQ=255) aactgacggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCg > 1:228345‑M2/223‑251 (MQ=255) gacggcgaatacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgatactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagttaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGatt < 1:412914‑M2/32‑1 (MQ=255) acggcgaaggcgtggaagtagggtatggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagcggatcaggtttttttattgcaatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGattta < 2:281787‑M2/34‑1 (MQ=255) acggcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtatggagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGattta < 1:504905‑M2/34‑1 (MQ=255) gcgaagacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGatttattt < 2:360204‑M2/37‑1 (MQ=255) gacgctgaagctgggtctggatacgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCg > 2:345121‑M2/210‑251 (MQ=255) ggggtatggattcgctgtgtattgagactgtagagcgtatttaatcgatttttcgtgagagagaagccggatcagggttagccgagcaggcttttatatcgccatctaaatttattctgaaaatggacatgccatggttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccgcagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACGGGTCGATTTACTTAACCGTTTTTTGTTCa < 2:141937‑M2/53‑1 (MQ=255) acgctgggtattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGatt < 1:357935‑M2/64‑1 (MQ=255) ggttattgagcctgtagagcgtctgaaatcgatttttcgtgcgagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatcttaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACAGTTTTCTGTTCATCGCCAAGATTAtttt > 2:208073‑M2/183‑251 (MQ=255) tattgagactgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCt > 1:84463‑M2/180‑251 (MQ=255) ctgtagagcgtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgctcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTa > 2:237903‑M2/172‑250 (MQ=255) gtggagcttatgtaatcaatttttcgtgagagtgaagccggatcagggttagcctatcaggattttttattgccatctaaaggtattctgaaaagggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggcccgagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAAt < 2:45348‑M2/81‑1 (MQ=255) gtatgtaatcgatttttcgtgagagtgaagcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGtac > 2:95642‑M2/163‑251 (MQ=255) cgagttttcgtgagagtgaagcctgatgagggtgagccgatcaggcttttttattgcaatctaaatgtatgctgaaaatggacatgccattgttttctcactggtggataagaggccagaagcgtaatatccggctccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATGATTTTTCTGGTGGTAAGGCTGGGActgctgctg < 2:143098‑M2/97‑1 (MQ=255) cgtgagagtgaagccggatcagggttcgccgataaggcttttttattgccatctaaatgtagtatgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagcggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATAtt < 2:251389‑M2/106‑1 (MQ=255) agcctgatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGaa < 1:95642‑M2/117‑1 (MQ=255) tatcaggtttagcctatcaggcttttgtattgccatctaaatttattctgaaaagggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTGCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAAtcg < 2:325922‑M2/120‑2 (MQ=255) gattagggttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaagggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCttt < 2:170540‑M2/122‑1 (MQ=255) gatcagggttagccgatcaggcttttttattgccatataaatggattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCttt < 2:493569‑M2/122‑1 (MQ=255) gttagccgatcaggcttttttattgccatctaaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCt < 1:277673‑M2/129‑1 (MQ=255) tgttttattaccatttagatgtattcggaaaagggacatgccattgtttgctcacagttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTTCTGCCGCATTTTCTCAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAgg < 2:162651‑M2/143‑1 (MQ=255) ttattgccatctaaatgtattcttaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGggct < 1:168697‑M2/147‑1 (MQ=255) taaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctaactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggacccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGCTTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGATGGCTCTGTCTGc > 2:159379‑M2/93‑251 (MQ=255) aaatgtattctgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCtctgtct < 1:131381‑M2/157‑1 (MQ=255) catgtattctgtaaatggacatgccattgatttctcactgttggagaattggccagaagcggaatatccggccccagggcaacgataacgCGGGGCTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTAGTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCAAAGATTCTTTTTCTGGTGGTAATGTTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTGTAACCCTGCCGTTGCAGCAGGGGCTGgccctgtctgta > 2:307559‑M2/91‑248 (MQ=255) tgaaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTg > 2:79303‑M2/82‑250 (MQ=255) aaaatggacatgccattgttttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGAtt > 2:311537‑M2/80‑251 (MQ=255) ttctcactgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGGCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGACTCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGTGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTc > 1:420804‑M2/60‑250 (MQ=255) actgttggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATGTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTa < 1:89095‑M2/197‑1 (MQ=255) ggataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGc < 1:312845‑M2/203‑1 (MQ=255) gataagaggccagaggcgtaatatccggccccagggaaacgattacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTGAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTGCACGGTAGCGTGcc < 2:417982‑M2/204‑1 (MQ=255) gataagaggccagaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGcc > 2:458723‑M2/48‑251 (MQ=255) aggcctgaagcgtaatatccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCTCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCTTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTAt < 1:470182‑M2/210‑1 (MQ=255) atccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTCTTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGACTCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTACCGTGCCGTGTATTGTCAGCTATatggat > 2:316465‑M2/26‑251 (MQ=255) atccggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATatggat > 1:448418‑M2/26‑251 (MQ=255) cggccccagggaaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGc < 1:345121‑M2/229‑1 (MQ=255) aaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATatggatgg < 2:440297‑M2/228‑1 (MQ=255) aaacgataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATatggatgg > 1:440297‑M2/12‑239 (MQ=255) gataacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTa < 2:210219‑M2/244‑1 (MQ=255) aacgCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACg < 1:79303‑M2/246‑1 (MQ=255) gcgCGTGGTTTGTGTGGGAACTTCTCTGGTCGATTTATTTAACCGTTGTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCt < 2:236968‑M2/248‑1 (MQ=255) | GCTATTACTGCTGGAGGTGTACCAGCATGTTCCGGCAGATACCGGTCTGGGCACGCTGGCAAAACGCTATCTGGGACGCTACGGTCAATGGCTGACGGGCTTCAGTATGATGTTCTTAATGTATGCTCTGACTGCGGCATACATCAGCGGTGCCGGTGAATTGTTGGCCTCCAGCATCAGCGACTGGACAGGTATTTCTATGTCGGCAACCGCTGGCGTGCTGTTGTTCACTTTTGTTGCCGGTGGCGTGGTTTGTGTCGGAACTTCACTGGTCGATTTATTTAACCGTTTTCTGTTCAGCGCCAAGATTATTTTTCTGGTGGTAATGCTGGTACTACTGCTGCCGCATATTCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCT > NC_000913/1989833‑1990326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |