| Read alignment evidence... | |||||||||||
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cgTGCTGGTTAACATCACGGCGGGCTTCG‑ACCTGCGTCTGGGTGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAAAGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGGATCGGCATGGACAAACGGCCTGAAATCACTCTGGTGACCCATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGGGATGGATCGCTACCAGCAGCATg > 1:45575/1‑251 (MQ=255) gTGCTGGTTAACATCACGGCGTGCTTCG‑ACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATgg < 2:211061/251‑1 (MQ=255) gTGCTGGTTAACATCACGGCGGGCATCG‑ACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAAAGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGGTATGAATGAAGAGCTGCGCGGAAACGGTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGGCAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAAAAAACAGGGTCAGCAGGCAGGGATGGATAGCTACCAgcagcaagg > 1:161108/1‑248 (MQ=255) 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tCG‑ACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGc > 1:11051/1‑249 (MQ=255) ccTGTGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGc < 2:70137/251‑1 (MQ=255) ccTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCTCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGc < 1:79353/251‑1 (MQ=255) gCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGcc < 1:408245/249‑1 (MQ=255) gTCTGGAGGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGTCAACTCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGtt < 2:195798/251‑1 (MQ=255) ggATGAGTTCGAAACGTTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCTCTCTGTTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTGCCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTg < 2:380241/248‑1 (MQ=255) aTGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTaaa < 1:461739/251‑1 (MQ=255) aTGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTaa > 1:279549/1‑250 (MQ=255) aTGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTaa > 2:152575/1‑250 (MQ=255) | GGCGCTGTGCAAGGTATCGCTGAACTGATTACTCGTCCGGGTTTGATGAACGTGGACTTTGCAGACGTACGCACCGTAATGTCTGAGATGGGCTACGCAATGATGGGTTCTGGCGTGGCGAGCGGTGAAGACCGTGCGGAAGAAGCTGCTGAAATGGCTATCTCTTCTCCGCTGCTGGAAGATATCGACCTGTCTGGCGCGCGCGGCGTGCTGGTTAACATCACGGCGGGCTTCG‑ACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGA‑CTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGA‑CCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAA > NC_000913/105875‑106372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |