| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 536,617 | Δ14,712 bp | [glxR]–[ybcF] | [glxR], ybbW, allB, ybbY, glxK, allE, allC, allD, fdrA, ylbE, ylbF, [ybcF] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 536617 | 551328 | 14712 | 47 [0] | [0] 48 | [glxR]–[ybcF] | [glxR],ybbW,allB,ybbY,glxK,allE,allC,allD,fdrA,ylbE,ylbF,[ybcF] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 536616 | 0 (0.000) | 47 (0.790) | 42/494 | 0.2 | 100% | coding (31/879 nt) | glxR | tartronate semialdehyde reductase 2 |
| ? | NC_000913 | 551329 = | 0 (0.000) | coding (891/894 nt) | ybcF | putative carbamate kinase | |||||
ATTATGATTATCTCTTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGCCGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTAACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCTGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTATGGGTACACCGATGGCCATTAATCTGGCGCGTGCCGGTCATCAATTACATGTCACGACCATTGGACCGGTTGCTGATGAATTACTGTCACTGGGTGCCGTCAGTGTTGAAACTGCTCGCCAGGTAACGGAAGCATCGGACATCATTTTTATTATGGTGCCGGACACACCTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCT > NC_000913/536368‑536865 | aTTATGATTATCTCTTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGCCGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTGACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCCGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTAgt > 1:272480‑M1/1‑249 (MQ=255) tctTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGCCGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTGACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCCGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTAgtagtcgtaggcat > 1:16386‑M1/1‑237 (MQ=255) tctTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGCCGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTGACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCCGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTAgtagtcgtaggcat > 2:44930‑M1/1‑237 (MQ=255) aaTCGAAAATTCTGACTACAACGGGTGGGTTGGGTGTGAATATAAACCCCAAACCACCACGGAAGACGGTTTACGCTGGATGGATCCGTACCGTTAAAACGTGACGCTATTCAGACAATGCTTTTTTAGGCCGCTAAGTTGGCAGGGGATCGTGTTGTCCGAATTCAGGAAAAGCGAAATTTAAAAGAGGTTAATTATGAAACTGGGATTTATTGGCTTAGGCATTAgtagtcggaggcattagacattt < 2:432740‑M1/250‑24 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |