| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 49 [0] | [0] 49 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 49 (0.830) | 46/494 | 0.1 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| ? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase | |||||
CACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCAGATAATGTCTAATATTTGGTCTAAAGAAGAAACTCTGTGGAGTTTCGCGCTCTACGGCACAGCCGTTGGTGCAGGCACGCTCTTCCTTCCTATTCAGTTAGGTTCGGCAGGGGCTGTGGTCCTGTTTATTACTGCTCTGGTCGCCTGGCCTTTAACATATTGGCCACATAAAGCCTTGTGCCAGTTCATCCTCTCATCAAAAACATCAGCAGGTGAAGGGATAACGGGCGCGGTAACACACT > NC_000913/2985603‑2986084 | cACCAATTATAAGTGCAATAGTTAATGAGTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTAGCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGTTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCCCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaacccc < 2:259739‑M1/251‑13 (MQ=255) cAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgac < 1:218947‑M1/251‑16 (MQ=255) ttAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTACAAAAAGAGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACAAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTATTTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatt > 2:182685‑M1/1‑233 (MQ=255) gTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACAACTAACCAACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaacccagacatttgccgg > 2:383031‑M1/1‑227 (MQ=255) 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ttAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgta > 1:374027‑M1/1‑208 (MQ=255) ttAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgta > 1:448181‑M1/1‑208 (MQ=255) aTTACAGGTACCTTAATTGTTTAATAAAAGTGATTTTTAACCCAAAGGAAATAGTCCTGAGACA‑CAGTCAGAGACATATCTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCTTGAATCTCTCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCTTTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataccgtgatgc < 2:50217‑M1/251‑47 (MQ=255) 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tGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggc > 2:34768‑M1/1‑152 (MQ=255) gCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggc < 2:149933‑M1/250‑100 (MQ=255) ccTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctt > 2:220148‑M1/1‑150 (MQ=255) 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CACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAG‑CAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCAGATAATGTCTAATATTTGGTCTAAAGAAGAAACTCTGTGGAGTTTCGCGCTCTACGGCACAGCCGTTGGTGCAGGCACGCTCTTCCTTCCTATTCAGTTAGGTTCGGCAGGGGCTGTGGTCCTGTTTATTACTGCTCTGGTCGCCTGGCCTTTAACATATTGGCCACATAAAGCCTTGTGCCAGTTCATCCTCTCATCAAAAACATCAGCAGGTGAAGGGATAACGGGCGCGGTAACACACT > NC_000913/2985603‑2986084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |