| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,417,058 | Δ10,734 bp | yfcC–[argT] | yfcC, yfcD, yfcE, yfcF, yfcG, folX, yfcH, rpnB, hisP, hisM, hisQ, hisJ, [argT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2417058 | 2427791 | 10734 | 68 [0] | [0] 68 | yfcC–[argT] | yfcC,yfcD,yfcE,yfcF,yfcG,folX,yfcH,rpnB,hisP,hisM,hisQ,hisJ,[argT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2417057 | 0 (0.000) | 68 (0.870) | 61/492 | 0.1 | 100% | intergenic (+166/‑24) | pta/yfcC | phosphate acetyltransferase/putative transporter YfcC |
| ? | NC_000913 | 2427792 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+265) | argT/ubiX | lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein/flavin prenyltransferase | |||||
CTTTCAGTGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAAT > NC_000913/2427545‑2428030 | gacctgtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACAt < 2:355897‑M2/4‑1 (MQ=255) acctgtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATa < 2:582283‑M2/5‑1 (MQ=255) tgtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAAcc > 2:314817‑M2/244‑251 (MQ=255) tgtcccgtgacgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAAcc > 2:312201‑M2/244‑251 (MQ=255) ccgtggcgctctggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcccagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaatttcgccctctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCa < 1:318575‑M2/12‑1 (MQ=255) cgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGaa < 1:222216‑M2/18‑1 (MQ=255) gcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgcttatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCACGTGaa > 2:197249‑M2/233‑250 (MQ=255) 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cccgcagctgtgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGACATCTTGACGacaa < 2:292009‑M2/96‑1 (MQ=255) ccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGacaa < 1:300103‑M2/96‑1 (MQ=255) agctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttcaggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcctcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAACATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGt > 1:508779‑M2/151‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |