| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 81 [0] | [1] 81 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 79 (1.010) | 73/492 | 0.0 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
TCCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTTATCAGATCACGCATCACCCGCATATGCGGTGCGGAGTAAGAATAAAACGCCTGATAGCCCGCACAAAGCACGCTGTCTGGCGTCTCCTGCCGAGCGTGCGGGCACAGGCGATGCCAGTCGCACGCCTGGCAGTCACAGCGCGGTTGCGGGTTTTCGCTGCCACACCATTTTTGTAAGGTGGCGTCAAAAAGCTCAATCGAGATACGACTGATATCTGCCCGCACCCAACACTCGAA > NC_000913/3854910‑3855395 | tCCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCtt < 1:523947/249‑1 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aCGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGCGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgc > 1:183472‑M1/1‑238 (MQ=255) gCTGGCGCGCTGGACGGCGGTCTGCAAAACCTTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgcctt > 2:178000‑M1/1‑235 (MQ=255) ggCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttata < 1:126409‑M1/251‑20 (MQ=255) 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TCCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTTATCAGATCACGCATCACCCGCATATGCGGTGCGGAGTAAGAATAAAACGCCTGATAGCCCGCACAAAGCACGCTGTCTGGCGTCTCCTGCCGAGCGTGCGGGCACAGGCGATGCCAGTCGCACGCCTGGCAGTCACAGCGCGGTTGCGGGTTTTCGCTGCCACACCATTTTTGTAAGGTGGCGTCAAAAAGCTCAATCGAGATACGACTGATATCTGCCCGCACCCAACACTCGAA > NC_000913/3854910‑3855395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |