| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,720,136 | IS3 (–) +3 bp :: +TCA | coding (88‑90/213 nt) | cspA → | cold shock protein CspA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 315229 = | NA (NA) | 41 (0.530) +TCA |
37/488 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3720136 = | 0 (0.000) | coding (88/213 nt) | cspA | cold shock protein CspA | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2171428 | NA (NA) | 78 (0.990) | 73/492 | 0.0 | 100% | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3720138 | 0 (0.000) | coding (90/213 nt) | cspA | cold shock protein CspA | |||||
AGTATGAGCGCAAAAGGTTGCTGCTACGATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2171180‑2171428‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTACGTCAAA < NC_000913/3720138‑3719894 AGTATGAGCGCAAAAGGTTGCTGCTACGATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACA < 2:522303/251‑1 GCGCAAAAGGTTGCTGCTACGATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTT < 2:50579/251‑1 AAAAGGTTGCTGCTACGATAATGCCTTCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCTCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGCATCACACATCTTTAGAa < 2:92973/251‑2 CGATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTG > 1:374762/1‑251 ATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTCTCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGACCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATAGT‑CCGGAGTGAT > 1:193869/1‑251 TAATGCCTGAGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGCAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCCACGGCGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGACCGGAAAAATTTGGAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGGGGGTAGGATCATACATCTTTAAAGTCATCGT‑CAGGAGTGgtg > 1:26313/1‑248 AATGCCTGCTTGGAAAGCTGCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTAGCCATGGAGAACACTGTATCAGCCGGGAAATGATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATAGGGAATGTGAGTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATGTGAAAGCAAGAACCTCGCTTAGGCCGGTGTTCATAGTAAGTGGGTAGGAGCACACTTCTTTAGCGCCATCTT‑CAGGAGTGATG < 2:117322/250‑1 gtCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATACGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACGTTATCGGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGGGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAAGTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATGACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAG < 2:416795/248‑1 GCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAAGCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGGGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACGCATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCG < 2:413015/249‑1 AGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGT > 1:384008/1‑251 TTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTC > 1:197565/1‑249 cCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTGTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACTCATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGC < 2:101598/250‑1 GAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTTAACCATTTT > 2:280425/1‑251 GAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTT > 2:465769/1‑251 GGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGAT < 2:329293/250‑1 ATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGACTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCc > 2:134500/1‑250 ATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTT > 1:116346/1‑251 ATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTT < 1:148760/251‑1 GAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACC < 1:156142/251‑1 AGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCG < 1:465769/251‑1 AGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGAGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCCGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGACTGTGTCCATATTACGAGGGTAAGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CCGGAGTGTTGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTAAGATCCCAGTCATTTTACCG > 2:448791/1‑251 GAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGG < 2:193869/251‑1 CACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACA < 2:554649/251‑1 CTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGCTTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCCGTCCGGAACAATTTGAAAACACGAACCTCGCTTAGGCCTTTGTCCCTATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTTTCAGCGTTGAACCATTTTAAGATACCAGTCATTTTACCGGACAT > 2:231412/1‑250 ATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAAACTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAAACATTTTACGATAACAGACATTTTACCGGACATAGTGT > 2:126090/1‑251 CAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTA < 1:55936/250‑1 CAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCAGCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTAT < 1:371124/251‑1 CGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACC < 1:547668/251‑1 GGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGG‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTT > 1:369167/1‑251 AATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAA < 2:57020/251‑1 AATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTA > 1:386734/1‑250 ATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGGCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGATGAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACCTACTTAGAGCCAT‑GTGCAGGGGTGATGACGCCGAAGTCTTTGTAAGCGTTGAACCATTTTAAGATACCAGTCAGTTTACCGGACATAGGGAATTACCGTTAATAAT > 2:313074/1‑251 GCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTA < 1:347515/251‑1 GCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTA < 1:478299/251‑1 GCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATT < 1:97184/250‑1 ggggAACGGTGTTTTATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCTGCACAGGTTGTGTGGCGGCCTCAGTCCTGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGGGGGGAGGATCACACATCTTTAGAGCCAGCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTTATCCATTTTACGATGCCCGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAG < 2:443946/247‑1 GGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTA > 1:552072/1‑249 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CGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCGTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTT < 1:473545/250‑1 CGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGT < 1:277510/251‑1 GCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGGCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGGATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCGTTACAGATTTTGAAGCGTTA < 2:635497/251‑1 GGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTATAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGC > 2:516471/1‑251 GGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTAC < 1:289280/251‑1 GGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACG > 1:305093/1‑249 TCAGTCCGGAACAATTGGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGCCATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGAGTTTGAAGAGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGT > 2:1331/1‑251 AGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGAGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGTGGGGTAT > 2:182809/1‑251 GTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATC < 1:266675/251‑1 tCAATTTGAAAACAAGAAATTCGCTTAGGCCTGTGTACATATTCAGAGGGACGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGACGAAGCATTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTACTAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTAACGCTTTTGAAGCTTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGAATCAACGAT > 2:442868/2‑250 TTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTC > 2:3278/1‑251 ACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGG > 1:121802/1‑251 AGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGAC < 1:134500/251‑1 CTCGCTTAGGCCTGTGTCAATATTACGTGGGTAGGATCACCCATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGCTCACTCTTGAAGGGACTTGCC > 2:495222/1‑251 CGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGA < 1:453447/184‑1 CGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGA > 2:453447/1‑184 CTTAGGCCTGGTTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTATGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTT < 2:512490/249‑1 TAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGTCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTCCCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACT < 1:45652/250‑1 GGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACA < 1:25603/251‑1 GTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCT > 2:190417/1‑251 GTCCATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTT > 1:123402/1‑251 ATATTACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGCGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATG > 1:161821/1‑251 TACGTGGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCT > 1:179711/1‑251 GGGTAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTAC < 1:569706/250‑1 GTAGGATCCCACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTCCGTC < 1:108098/251‑1 TAGGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTACGTC > 1:33393/1‑250 GGATCACACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTACGTCAAA < 1:501174/251‑1 AGTATGAGCGCAAAAGGTTGCTGCTACGATAATGCCTGCGTGGAAAGCTTCTTTCATTCGCTGAAAGTGGAATGTATCCATGGAGAACACTTTATCAGCCGGGAAATAATGCGGGCAACGGTGTTTAATTATATCGAATGTGATTACAATCGGTGGCGGCGGCACAGTTGGTGTGGCGGCCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2171180‑2171428‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCACATCTTTAGAGCCATCGT‑CAGGAGTGATGAAGCCGAAGCCTTTGTCAGCGTTGAACCATTTTACGATACCAGTCATTTTACCGGACATAGTGTATTACCTTTAATAATTAAGTGTGCCTTTCGGCGATATGGCGTGCTTTACAGATTTTGAAGCGTTAAAGGAATGTGCACTACGAGGGGTATCAACGATAACTCTTGAAGGGACTTGCCTTACTACACTGCTTTAATGGTCTGTACGTCAAA < NC_000913/3720138‑3719894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |