| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,048,805 | Δ48,085 bp | [gfcB]–ycdU | 45 genes [gfcB], gfcA, insA4, insB4, cspH, cspG, ymcF, ymcE, gnsA, yccM, torS, torT, torR, torC, torA, torD, cbpM, cbpA, yccE, agp, yccJ, wrbA, ymdF, rutG, rutF, rutE, rutD, rutC, rutB, rutA, rutR, putA, ymdG, putP, efeO, efeB, phoH, pgaD, pgaC, pgaB, pgaA, dgcT, insF4, insE4, ycdU |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1048805 | 1096889 | 48085 | 49 [0] | [0] 49 | [gfcB]–ycdU | [gfcB],gfcA,insA4,insB4,cspH,cspG,ymcF,ymcE,gnsA,yccM,torS,torT,torR,torC,torA,torD,cbpM,cbpA,yccE,agp,yccJ,wrbA,ymdF,rutG,rutF,rutE,rutD,rutC,rutB,rutA,rutR,putA,ymdG,putP,efeO,efeB,phoH,pgaD,pgaC,pgaB,pgaA,dgcT,insF4,insE4,ycdU |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1048804 | 0 (0.000) | 49 (0.720) | 44/490 | 0.3 | 100% | coding (529/645 nt) | gfcB | lipoprotein GfcB |
| ? | NC_000913 | 1096890 = | 0 (0.000) | intergenic (+61/+675) | ycdU/serX | uncharacterized protein YcdU/tRNA‑Ser | |||||
GTGATGTGGATTACGCTGGTGTCGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC > NC_000913/1096641‑1097134 | caacattttccacggggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgAt < 2:7018‑M2/2‑1 (MQ=255)aaacattttccacggggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgAt < 2:214966‑M2/2‑1 (MQ=255) attttccacggggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgcacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgAttgtt > 2:443381‑M2/246‑251 (MQ=255) tccacggggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGAc < 1:121816‑M2/9‑1 (MQ=255) ccacggggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcatataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtttcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactgtgacgaacctggccattggccgaatcgacccagaaggtgttttgccgctgATTTTTGACt < 2:441594‑M2/10‑1 (MQ=255) gggccaacggaaagtgtctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTa > 2:541600‑M2/236‑250 (MQ=255) gtgtctgtgatacaccaggcagataaatagtcacagttccttgagcaaagggatggggtgtcatttcgtaaagtccgctggtaatgaaatacgacagtaatttagtcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataaccccagcgcctaacatttgccgactttgacgagcctggccagtagccgaatcgacccagaatgttttttgcggctgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAATTgac < 2:540243‑M2/29‑2 (MQ=255) tctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgctccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgTTTGTTGAATGAGTAACCAGACAGTTGAtgtg > 2:502077‑M2/220‑251 (MQ=255) gctgttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGAtgtg < 1:253517‑M2/32‑1 (MQ=255) gttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGc < 1:43118‑M2/33‑1 (MQ=255) ttgttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACg > 1:459211‑M2/216‑251 (MQ=255) ttcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggagcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGAtt > 2:133033‑M2/213‑251 (MQ=255) tcaccaggcagataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGAtt < 2:444601‑M2/39‑1 (MQ=255) tcaccaggcagataaatagtcaccggtccttgcgcaaaggcatggggtggcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcggggttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGAACGAttt > 2:326882‑M2/212‑251 (MQ=255) ataaatagtcaccgttccttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCt < 2:130811‑M2/51‑1 (MQ=255) cttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccggtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCgggg > 2:352644‑M2/184‑251 (MQ=255) cttgcgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggattaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCgggg > 1:401334‑M2/184‑251 (MQ=255) cgcaaaggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccggatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCAc > 2:191358‑M2/180‑251 (MQ=255) aggcatggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCcggg > 2:254105‑M2/175‑250 (MQ=255) atggggtgtcattacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtgtgt < 1:233507‑M2/81‑1 (MQ=255) tacgtaaagtacgctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTTTGTGCAATATACGa < 2:193589‑M2/92‑1 (MQ=255) gctggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGt < 2:188587‑M2/105‑1 (MQ=255) ggcaatgaaatacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACt < 1:326066‑M2/108‑1 (MQ=255) tacgactgtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACg > 1:438937‑M2/134‑249 (MQ=255) gtaatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCtctt < 2:298780‑M2/123‑1 (MQ=255) aatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCttt > 2:373654‑M2/125‑251 (MQ=255) aatttattcatggtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCttt < 1:254105‑M2/127‑1 (MQ=255) gtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTCCGAGCTCTTCTTTAAATATGGcggg > 2:8509‑M2/113‑250 (MQ=255) gtgcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGt < 1:541600‑M2/139‑1 (MQ=255) gcgggtttaagaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTg > 1:460492‑M2/111‑250 (MQ=255) agaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGGTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGAGGGGAt < 2:71780‑M2/150‑1 (MQ=255) gaaacgtcatttctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGAtt < 1:544907‑M2/151‑1 (MQ=255) ctacgggaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctgaccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCACTATACGAAACAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTtaaatatggcggtgaggggggggtggaggcccctcgc > 2:439110‑M2/89‑236 (MQ=255) gaataacccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGccc < 1:284976‑M2/169‑1 (MQ=255) accccagcggctaacatttgccgactttgacgcaccttgccagtagacgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCCCCCGGTGTGTGCAATTTACGAAAAAAAAGCCCGTCCTTTCTTACGAGCTCTTCTTGAAATATGGCGGTGATGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCgg < 2:255211‑M2/174‑1 (MQ=255) ccctgcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccggtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGc < 1:352644‑M2/176‑1 (MQ=255) gcgcctaacatttgccgactttgacgaacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGTGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTGTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACGCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGc < 1:152633‑M2/179‑1 (MQ=255) caattgccgactttgaagaacctggacagtagacgaatcgacccagaatgttttatgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGGGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAATCCCGCGCTTTCGTACGATCTCTTCTGGAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCTCTACGATCGCCCTGCGGGCATCCAGCTCACt < 2:439790‑M2/188‑1 (MQ=255) atttgccgactttgacgcacctggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGAACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGGTTGAATCGCTTCGCTCGCCCcgcgggccgcccgccacctc > 1:377097‑M2/63‑245 (MQ=255) gacgaaccgggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTg < 2:527045‑M2/202‑1 (MQ=255) ggccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGcc < 2:299582‑M2/168‑1 (MQ=255) gccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGc < 2:761‑M2/212‑1 (MQ=255) ccagtagccgaatcgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCt < 2:304089‑M2/213‑1 (MQ=255) cgacccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGTCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTc < 1:408454‑M2/226‑1 (MQ=255) ccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGGGGGGGGGATTGACTCGCTtcgctcg > 1:261933‑M2/22‑187 (MQ=255) ccagaatgtgttttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTtcgctcg < 2:261933‑M2/166‑1 (MQ=255) ttgccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACATTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCgggg < 1:511972‑M2/241‑1 (MQ=255) gccacggATTGTTGTCTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCTCGATTTCCGCTCGCCCTAACAGACTGGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGGCGACCCACGGTCGGGGCtt < 2:401334‑M2/244‑1 (MQ=255) ccactgATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGAATCGCTTCGCTCGCCCCGCGGGCAGCCCCCCCCCTGCGTTCACCGTCTTTCCCACTGGCTGTCGCCAGGTGTCGACCCCCGGCCGgggcctc > 1:420917‑M2/7‑248 (MQ=255) | GTGATGTGGATTACGCTGGTGTCGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC > NC_000913/1096641‑1097134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |