| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,235,905 | 16376 bp→AAGTAAAGGAAAACATCAACGTTCGCAAAAGAAAATGCCGATTTGCGGCCGC | yjbE–malM | yjbE, yjbF, yjbG, yjbH, yjbT, psiE, xylE, malH, malG, malF, malE, malK, lamB, malM | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4235905 | 4252280 | 16376 | 36 [0] | [0] 37 | yjbE–malM | yjbE,yjbF,yjbG,yjbH,yjbT,psiE,xylE,malH,malG,malF,malE,malK,lamB,malM |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4235904 | 0 (0.000) | 25 (0.460) +AAGTAAAGGAAAACATCAACGTTCGCAAAAGAAAATGCCGATTTGCGGCCGC |
24/390 | 0.8 | 100% | intergenic (+497/‑2) | pgi/yjbE | glucose‑6‑phosphate isomerase/uncharacterized protein YjbE |
| ? | NC_000913 | 4252281 = | 0 (0.000) | intergenic (+1807/‑225) | malM/ubiC | maltose regulon periplasmic protein/chorismate lyase | |||||
TAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTTATGAAAAAAGTTCTGTATGGCATTTTTGCCATATCTGCGCTTGCGGCGACTTCTGCGTGGGCTGCACCTGTACAGGTGGGCGAAGCGGCAGGGTCGGCAGCAACGTCGGTTTCGGCGGGGAGTTCCTCCGCGACCAGCGTCAGCACCGTAAGCTCGGCGGTGGGTGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAG > NC_000913/4235659‑4236153 | tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagt > 1:441904‑M1/1‑246 (MQ=255) gctttttaaTCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAATTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGAATGCTTTAGTTGTGTAAACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaa > 2:346305‑M1/3‑244 (MQ=255) ttttCATCGGTGTTTATTACGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGCTTATGTTTTTTATTGTTATTTAAATTTAAGTTGATACTTATGATTGATATTCATTCTAATTATCCTAAAACACCATAGCCAATTCCCCGAGCCGTAATTCTCATGATTTAGTTGTTTATGCTCGATCCCGGCCGAAATGTTTTTGGGTACATCTTCATTCATTCACTAAAGGCAAATTGtaattacaga > 2:479691/1‑241 (MQ=255) ttCGGAAAATTCGCAGATTAATTGCTTTTGGTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTAAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTGGGGTAAAACTCCACTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgc < 1:346305‑M1/250‑27 (MQ=255) tCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgca > 1:455207‑M1/1‑223 (MQ=255) ggAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaa < 1:199007‑M1/251‑31 (MQ=255) aaaaTACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaaga < 1:303223‑M1/251‑33 (MQ=255) 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ttGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcgg > 1:419612‑M1/1‑203 (MQ=255) gTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacat > 1:512584‑M1/1‑182 (MQ=255) tATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcc < 1:102219‑M1/250‑87 (MQ=255) ataAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtg > 1:135210‑M1/1‑155 (MQ=255) aCTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacg > 1:135778‑M1/1‑145 (MQ=255) cTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacgg > 1:146664‑M1/1‑144 (MQ=255) 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gtATACTCGTTCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgcttagtaaaggaaaacatcacctttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatacgattgttgcgttgttg < 1:109638‑M1/251‑187 (MQ=255) aTCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtatt > 2:90375‑M1/1‑56 (MQ=255) gcccgAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatc < 1:416694‑M1/251‑201 (MQ=255) aaaTGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatcactt > 1:67370‑M1/1‑46 (MQ=255) gTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatcacttaattt > 2:473603‑M1/1‑42 (MQ=255) ttttGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatcacttaatttgc > 2:258029‑M1/1‑40 (MQ=255) 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tGTaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagaaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatcacttaatttgctttacatctcccgtaaacacttttctgcgatacaatg > 1:345087‑M1/1‑3 (MQ=255) gtaagtaaaggaaaacatcaacgttcgcaaaagaaaatgccgatttgcggccgctaagtaaaggaaaacatcaccgttcctggcatcctggacggtgatgcccctacggttgccctcgccagcacgggcatcggtaaagcgtaaggttcaacatcgttttaccacttcatgcgattgttgcgtttttgttgcgtattagatcacttaatttgctttacatctcccgtaaacacttttctgcgatacaatgc > 1:331422‑M1/1‑2 (MQ=255) | TAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAATTGTTATGAAAAAAGTTCTGTATGGCATTTTTGCCATATCTGCGCTTGCGGCGACTTCTGCGTGGGCTGCACCTGTACAGGTGGGCGAAGCGGCAGGGTCGGCAGCAACGTCGGTTTCGGCGGGGAGTTCCTCCGCGACCAGCGTCAGCACCGTAAGCTCGGCGGTGGGTGTCGCGCTTGCGGCAACCGGTGGCGGTGATGGTTCTAATACCGGGACCACCACAACCACGACCACCAGTACCCAGTAATAAAG > NC_000913/4235659‑4236153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |