| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,557,469 | 0 | T | G | 22.1% | 195.5 / 10.6 | 86 | Y404S (TAC→TCC) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/40); new base G (18/1); total (45/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.50e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GACGGCGCGGGGGCCGCTTGTCCCATTGACGCCATCACGCTGCGTACAATTTCTTCAATCTGTTTTTGATCCATGATATGTTATCTCCGCGTCATCAGAAGAACAGTGACGGATCGCCCGCCCGTTTGGTCAGGCGACCGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCAT‑CCCCATGAT‑GTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATC‑ATC‑AGGTTTTCGT‑TGAGGTTCTGGTCAGCGTCAGCGTGGTTGGTATAACAGCAGTCACAGCCCATAGAGATGCCGCTCAGCTTGCCCATAAAGTGATCTTCTAAGCCAGCACGGATAATCTGGCGGTCGTTGTAGAGATACTCCGGCCCAATAAAGCCGACCACGGTGTTGACGAT > NC_000913/2557224‑2557716 | gACGGCGCGGGGGCCGCTTGTCCCATTGACGCCATCACGCTGCGTAAAATTTCTTCAATCTGTTTTTGATCCATGATATGTTATCTCCGCGTCATCAGAAGAAAAGTGACGGATCGCCCGCCCGTTTGGTCAGGCGACCGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt < 1:338325/249‑1 (MQ=255) cgcgGGGGCCGCTTGTCCCATTGACGCCATCACGCTGCGTACAATTTCTTCAATCTGTTTTTGATCCATGATATGTTATCTCCGCGTCATCAGAAGAACAGTGACGGATCGCCCGCCCGTTTGGTCAGGCGACCGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGGGGTCTGGGAGTTGAGCat > 1:488389/1‑251 (MQ=255) ggCCGCTTGTCCCATTGACGCCATCACGCTGCGTACAATTTCTTCAATCTGTTTTTGATCCATGATATGTTATCTCCGCGTCATCAGAAGAACAGTGACGGATCGCCCGCCCGTTTGGTCAGGCGACCGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGGGGAATGCGGTGGTCTGGGAGTTGAGCATGATGt > 1:265777/1‑250 (MQ=255) ccGCTTGTCCCATTGACGCCATCACGCTGCGTACAATTTCTTCAATCTGTTTTTGATCCATGATATGTTATCTCCGCGTCATCAGAAGAACAGTGACGGATCGCCCGCCCGTTTGGTCAGGCGACCGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat < 1:433420/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |