Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,244,212 | 0 | C | T | 25.4% | 100.6 / 10.9 | 67 | G101G (GGC→GGT) | yeiG | S‑formylglutathione hydrolase/S‑lactoylglutathione hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/12); new base T (0/16); total (39/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.30e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.39e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GACACGACTCCAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCAC‑CACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGG‑A‑TTGTACTGGTG‑ATGCCAGAC‑ACCAGCCCGCGCGGCGAAAA‑GGTTGCCAACG‑ACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTT‑AATGCCACGCAACCGCCGTGGGC‑GACGCATTACC‑GGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGT > NC_000913/2243962‑2244459 | gACACGACTCCAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACCCTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCAC‑CACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGG‑A‑TTGTACTGGTG‑ATGCCAGAC‑ACCAGCCCGCGCGGCGAAAA‑GGTTGCCAACG‑ACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGc < 1:530980/251‑1 (MQ=255) cacGACTCCAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTTGCTTTCTCCCTCCACCTCGTGAGCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCAC‑CACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGG‑A‑TTGTACTGGTG‑ATGCCAGAC‑ACCAGCCCGCGCGGCGAAAA‑GGTTGCCAACG‑ACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCtt < 2:328478/251‑1 (MQ=255) ccAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCAC‑CACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGG‑A‑TTGTACTGGTG‑ATGCCAGAC‑ACCAGCCCGCGCGGCGAAAA‑GGTTGCCAACG‑ACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCtt < 1:200146/251‑1 (MQ=255) cccTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCAC‑CACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGG‑A‑TTGTACTGGTG‑ATGCCAGAC‑ACCAGCCCGCGCGGCGAAAA‑GGTTGCCAACG‑ACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTT‑AATGc < 2:386847/250‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |