Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,228,278 | 0 | G | C | 31.2% | 75.2 / 12.0 | 49 | intergenic (‑1008/‑704) | yohF/yohP | putative oxidoreductase YohF/putative membrane protein YohP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (18/15); new base C (9/6); total (27/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCATATCCGGTGC > NC_000913/2228030‑2228528 | gggTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGcc < 1:82310/251‑1 (MQ=255) gCATTAATTTCGGTGTCCGCTCCTTCAATTTAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGAGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGAAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTcc < 2:260299/251‑1 (MQ=255) gCATTAATATCGGTTTCCACCCCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTcc < 1:264833/251‑1 (MQ=255) aTTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATT‑GCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGGTT‑GGTCGCGATCCCCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCCTACCC‑AGGCGGGG‑AG‑GAA‑CCCCCCCCCGCCTCTTTccccc > 1:598943/1‑250 (MQ=255) tAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCa < 1:410251/250‑1 (MQ=255) atCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGGTT‑GCTCGCCTTCCGCC‑CCCCCTTCCTTTAACC‑CACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAAACCCCCCCCCGATCCTTCccccccatt > 1:161267/1‑246 (MQ=255) tCGGTTTCCCCACCTTCAACTGAAGAAGTACTCCCGTTCTGATATAGCCGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTTCTCTTTTTCTATTTTCTGCAA‑GACCGTGTTTATC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACCCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAC‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGatat < 2:361613/250‑1 (MQ=255) gTTTCCACACCTTCAACGGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCgag < 2:175867/251‑1 (MQ=255) ccACACCTGCAACTGAAGAAGTAATCCCGTCCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCGCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCGGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑TTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑Tg < 2:274595/250‑1 (MQ=255) cacCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAg < 1:471775/251‑1 (MQ=255) tCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCCCGGGCGGCCGAG‑‑AA‑CC‑CCCCCCCCTTCTTTTCCCAGATATCGAGG‑TGCCAGccccc > 1:275753/1‑249 (MQ=255) cAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGAGCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTTTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GGAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGTTTCTTTCGCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCccgcc < 1:512816/251‑1 (MQ=255) aaTCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGGTT‑GCTCGCGTTCCCCC‑CCCC‑CGGCTTTTACCCTACCC‑CGGCGGGG‑AGGTAA‑C‑TCCCCCCGCTTCTTTCCCCCGATATCGCGA‑TTCCACCCCCCCCTTTAGCCaaaa > 1:618662/1‑250 (MQ=255) cccGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑TCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑CGGGTTTTACCCTACCC‑AGGCGGGG‑AG‑GAA‑CCTCCGCCCGATTTTTTTCCCAGATAACGAGA‑TACCAGCCCGCCGGTaaacccaaaatac > 1:525097/1‑240 (MQ=255) gTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑TCCCGCGGTTCGCC‑GCCC‑GTGGTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGG‑AG‑TGA‑ACTCCGCCCGATTCTTTTCCCCGATATCGAGA‑TGCCCACCCCCCGGTAAGCCaaaaataacgt > 1:503889/1‑244 (MQ=255) gATAGAGCTGGCGTTGGGTCGCGATAATGGTGTTCTGTTCTTTTTCTTTTTGCTGAAA‑GCCCTTGTTTACC‑GCCGCGTGGTTTT‑GCCACTCCCATTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GAAATGG‑GGGGTTTT‑GCTCGCGTTCCCCC‑GTCC‑GTGTTTTACCCGTCCCC‑AGGGGGGC‑GG‑GAA‑CCCCCTCCCGAGTCTTCCCCCAGATACCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGgtg < 1:502962/251‑1 (MQ=255) aGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑TCTCTCGTTCCCCC‑GCCC‑CGGCTTTAACCCCACCC‑AAGCGGGC‑CA‑TAA‑ACTCCGCCCCTTTTTTTCCCCCGATAACTAGA‑AGTCAGCCCCCCGTTTACCCAAAAATACCGGTgggtgaccc > 1:629783/1‑244 (MQ=255) tCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑TCTCGCGTTCCCCC‑GCCC‑CCGCTTTTACCCTACCC‑CGGCGGGG‑AG‑TAA‑CCCCCCCCCGGTTTTTTTCCCCGATATCGGGA‑TGCCCGCCCCCCGTTTAACCCAAAGTACCGTTTgtgttaccccggcccgg > 1:455638/1‑238 (MQ=255) gggTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GCCCGTGTTTAAC‑GCCGCCGGGTTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGTTTTACCCGTCCCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATACCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTc < 1:42680/250‑1 (MQ=255) tatggttgtTCTGCTCTTTTTCTATTGGC‑GCAAAGCCCGTGTTAACC‑GCCGCTGGGGTTC‑CCCACTCCAAGTATTGGCGGCTTACGCTCCCAGCCA‑GTAATTG‑GCGGTTTT‑GCCCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GGCCTTTACCCGTACCC‑AGGCGGGT‑AG‑TAC‑CCCCCGCCCGTTTCTTTCCCCAAATACCGGGA‑GGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGc < 1:454606/244‑1 (MQ=255) gttcggttctTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTACC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCCCTCCAAGAACAGGCGGGCTCCCCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCCCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑GGGCGGGA‑AG‑TAC‑CCCCCCCCCGATGCTTCCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGAt < 1:353598/244‑1 (MQ=255) gtTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGGTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑CCCC‑GGGCTTTAACCGTACCC‑AAGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCCCCCGGTTCTTTTCCCAGATATCCAGA‑TGCCAACCCCCCGGTTAGCCAAAACGACCATTGGTGTACCCAC‑GGGC‑GGGCGTACCTCCGGcccggg > 1:259551/1‑247 (MQ=255) tttCTATTGGCCGCAA‑GCCCGTTTTTAAC‑CCCGCCTGGTTTT‑GCCCCTCCCAGTAAGGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCCCC‑GCCC‑GTTCTTTAACCGTCCCC‑AGGCGGAC‑AG‑TAC‑CCCCCCCCCGATTCTTTCCCCATATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc < 1:297403/250‑1 (MQ=255) cccggtTTAACCGCCGCGTGGTTTT‑GCCTCCCCCAGTCCAGGCGGTCCACGCTCCCACCCA‑GCAGTGG‑GCGGGTTT‑GCTCGCTTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTCCCC‑AGGCGGAT‑AG‑TAC‑CCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATAGCGAGA‑TGCCCGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGcc < 1:295350/247‑1 (MQ=255) acaC‑GCCGGCTGGGTTT‑GCCCCGCCCAGTACAGGCGGGCTACGTTGCCGGCAA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCACGCGTCCCGCC‑GCCG‑GTGCTTTAACCGTACCA‑GGGCGGGA‑AG‑TAA‑CCCCCGCCCGATTCTGTCCCAAGATAGCGTGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGcc < 1:570142/248‑1 (MQ=255) aaC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGGACCC‑CGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTTAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑CGGCCGGTCGTACCTTCGGCCCGATCGGTTAGAGCCAACGGGCCCCTTTAGCCCTCTGcccg > 1:53696/1‑249 (MQ=255) acgcgtcgcTGGGTTTTGCCACTCCGAGAGCAGGCGGGCTTCTCGGCCAGCCA‑GC‑‑TTGTGCGGGTTTTGCTTG‑GTTCCGCCCGCCG‑GGTCTTTACCCGCACCC‑GGGGGGGC‑A‑‑TTA‑CCTCCCCCCGTTTTTTTCCCCAATTATAGGGAATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCg < 2:4529/243‑1 (MQ=255) aC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑CCCC‑GCGCTTTAAACGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑CAA‑CCTCCCCCCGATTCTTTCCCCCGAAATCGAGA‑TGCCAACCCCCCCTTAAGCCAAAAAGACCGTTTGTGTACC‑ACCGGGCCGG‑CGGCCCTGCGGGCGGGTCGTTCAGAGAAAACCGCCCCCTTAAGCCTTCTGCCgcc > 1:326885/1‑249 (MQ=255) cgccTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGGTT‑TCTCGCCGTCCCCC‑GCCC‑GTGCGTTAACCCCACCC‑ACGCGGGC‑CG‑TAA‑CCCCCCCCCCGTTCTTTTCCCAGATATCGGGA‑ATCCAGCCCCCCGGTAAACCAAAAACACCCTTGGGGGTCC‑AC‑GGGCCCGTCGGACCTGCGGCCGGGTCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTTCCGagcttt > 1:245432/1‑246 (MQ=255) ccTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GGGCTTTAACCGTACCC‑AAGCGGGC‑AG‑GAA‑ACTCCCCCCCGTTCTTTTCCCAGATATCGAGA‑TGCCCGCCCCCCGTTAAACCAAAAGTACCGTTGGTGTAAC‑AC‑CGGCCCGTCGTACCTTCGGCCGGATCGGTTAGAGCAAAAGGCCCCCTTAAGCCTTCTGCCGACAttttt > 1:338049/1‑251 (MQ=255) cgggtttttccccTCCAAGTACAGGCGGTCTCCGCGGCCA‑CCATGCAATTG‑GCGGTTTT‑GCTCGCGTTCCCCC‑GCCC‑GTTCTTTAACCGTCCCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAC‑CCCCCGCCCGATTCTTCCCCAAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAtttttt < 1:241247/239‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTAACGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGGCGTACCTGCGGCCGGATCGGTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGaa > 1:597079/1‑250 (MQ=255) cGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGGACC‑AC‑GGGCCGGTCGGACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTc > 1:384338/1‑251 (MQ=255) gggTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACt > 1:452493/1‑251 (MQ=255) ggTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTg > 2:236186/1‑251 (MQ=255) tt‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCt > 1:587910/1‑251 (MQ=255) cctcgtgtcccgcc‑cCCC‑GTGCTTAACCCGTCCCC‑AGGCGGGC‑AG‑ACC‑CCCCCCCCCGTTTCTTCCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTc < 1:96597/242‑1 (MQ=255) 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ggccC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGA‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCTAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCGGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACCGCCCCATTAAGCCTTCTCCCGACATTTTTTGACTCTCCATATCCGCCAAAAAGACGAACTGCGGCCCATCCTGAGTGGCCACCGACTTCGCCTGGGcgtc > 2:32526/2‑246 (MQ=255) tttAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGa > 2:461420/1‑250 (MQ=255) tttacccttcccagggggggaataca‑CCTCCCCCCTATTGTTTCCCCAAATACGGAGA‑TCCCCGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGa < 2:597079/225‑1 (MQ=255) 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gCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCATATCCGGTGc > 1:611363/1‑251 (MQ=255) | GGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAA‑GACCGTGTTTAAC‑GCCGCCTGGGTTT‑GCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCA‑GCAATTG‑GCGGGTTT‑GCTCGCGTTCCGCC‑GCCC‑GTGCTTTAACCGTACCC‑AGGCGGGC‑AG‑TAA‑CCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGA‑TGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACC‑AC‑GGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCATATCCGGTGC > NC_000913/2228030‑2228528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |