| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,196,474 | Δ29,182 bp | [yehF]–yohC | 21 genes [yehF], yehI, yehK, yehL, yehM, yehP, yehQ, yehR, yehS, btsR, btsS, mlrA, yohO, yehW, yehX, yehY, osmF, bglX, dld, pbpG, yohC |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 2196474 | 2225655 | 29182 | 53 [0] | [0] 54 | [yehF]–yohC | [yehF],yehI,yehK,yehL,yehM,yehP,yehQ,yehR,yehS,btsR,btsS,mlrA,yohO,yehW,yehX,yehY,osmF,bglX,dld,pbpG,yohC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2196473 | 0 (0.000) | 53 (0.690) | 48/494 | 0.3 | 100% | intergenic (+140/‑1) | metG/yehF | methionine‑‑tRNA ligase/PF05406 family protein YehF |
| ? | NC_000913 | 2225656 = | 0 (0.000) | intergenic (‑25/‑145) | yohC/yohD | putative inner membrane protein/DedA family protein YohD | |||||
AACAAGACAGCCAGCGCCAGTCCGGTAAACCAGGATAACTTCAGGATAGTGCCATCGCCAAAATTCCAGCCAATCTGTGTAGTGCCAATGAAGGCGCAAATCACCGGAATCGCCGCCATCAGCAAAACGTGGTGGGTGTAATGGTGAGAAATCGTTTCGTTTTCGCGATTAATCACCTGCATTTCACGATCGGGATGGGAAAACAGTCCCCAGACATGGCTCATACCGCCCCCTTGTTGTGAGTTCATGAACCTGACAGTTCAAGTATAAGTCAGCTTGTGATTATTTTTTGTTCGCCCATGTAATTTTCACTGTCTGATGAACGTCCTTTTTCAGCGTGAATGATTCACAGGGTGTATGCTTACTGGCAACCAAAGGGAGACAGACTGGCCTATGGATCTCAATACACTTATCTCACAATATGGTTATGCCGCGCTGGTGATCGGTAGCCTGGCGGAAGGTGAAACCGTGACTTTGCTGGGAGGCGTTGCGGCGCATC > NC_000913/2225408‑2225906 | cgcttcggtatctctgaaggcttggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccggatgccggtgctaaaccgggtcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcgtgcgattttgtctctcgctaacccgcagaaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagaGaa < 2:429340‑M2/3‑1 (MQ=255) tcggtatctctgaaggcatggttatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccggatgccggtgctaaaccgggtcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcttgcgattttgtctctctctaacccgcataaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagaGAAcc < 1:570352‑M2/5‑1 (MQ=255) tcggtatctctgaaggcatggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccggatgccggtgctaaaccgggtcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcttgcgattttgtctctctctaacccgcataaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagaGAAcc < 1:345338‑M2/5‑1 (MQ=255) ctctgaaggcatggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccggatgccggggctaaaacgggtcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcttgcgattttgtttatctttaacccgcataaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagcGAACCTGACAGtt > 1:549223‑M2/238‑250 (MQ=255) 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atggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccgggtgccggtgctaaaccggggcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttggtttcttgcgattttgtctctctctaacccgcataaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagaGAACCTGAAAGTTCAAGTATAagg > 2:465913‑M2/228‑250 (MQ=255) ggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatattttcctgctaagcccggatgccggtgctaaaccgggtcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcttgcgattttgtctctctctaacccgcataaatactggtagcatctgcattcaactggataaaattacagggatgcagaGAACCTGACAGTTCAAGTATAAGTCa < 2:631163‑M2/26‑1 (MQ=255) ggtgatggctgccggtcctggcgggaaagatatttgccggctaagcccggattccggtgctaaaccggggcatcaggtgaaataatcccccttcaaggcgctgcatcgacagcgccttttctttataaattcctaaagttgttttcttgcgattttgtctctctctaacccgcataaatcctggtatcagctgcattcaactggataaaattacagtgatgctgaGAACCTGCCAGGTCAAGTATAAGTc < 2:481640‑M2/25‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |