| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,077,568 | Δ1,832 bp | [cmtA]–cmtB | [cmtA], cmtB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3077568 | 3079399 | 1832 | 36 [0] | [1] 36 | [cmtA]–cmtB | [cmtA],cmtB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3077567 | 0 (0.000) | 35 (0.460) | 33/492 | 0.9 | 100% | coding (1293/1389 nt) | cmtA | mannitol‑specific PTS enzyme IICB component CmtA |
| ? | NC_000913 | 3079400 = | 0 (0.000) | intergenic (‑70/+244) | cmtB/tktA | mannitol‑specific PTS enzyme IIA component CmtB/transketolase 1 | |||||
ACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077344‑3077567‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACC > NC_000913/3079400‑3079632 ACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT > 2:437283/1‑251 AGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAAC < 1:594541/251‑1 GAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAAa > 2:483604/1‑249 ACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTGCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGTATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGAGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAA < 2:565393/250‑1 CTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTAT > 1:99304/1‑251 TTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTAT > 1:582720/1‑251 TCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGGTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTAT > 2:311061/1‑250 TTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA > 2:59270/1‑250 CGGTAATTTCTTGCAGTTCAAATTCGCGCAGACGTACATCCCGCTTGCCATAAATATCAGCAATTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTATTCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCTCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATT < 2:512260/251‑1 TTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTAT > 1:358245/1‑251 GGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGAT < 1:372240/251‑1 GGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGACATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAG < 2:358245/249‑1 ACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAA < 1:59270/250‑1 GGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGC > 2:313842/1‑251 AATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTAC > 1:344818/1‑251 gcatCTTTGGTTTTTATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGTGTTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATTGTTAGTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAAGTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATATTAACAAATGGCGATACGCATATCGTGATTTATATTACATAATTG < 2:576757/247‑1 CAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTG > 1:168616/1‑250 TTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATT < 1:263477/250‑1 TTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATT < 2:200801/250‑1 GGTTTTCATTTTTACCGCTGTAATCAGTGTTTATGTTCTGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGTATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGGTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAAGACGCATATCGTTATGCATATTACATAATTGATATTTAT < 2:515744/251‑1 GTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAAGTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACTCAGATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATT < 1:535938/251‑1 TTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAAACGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTTTTATATAAAATTAAGTTAAAGATAAAACAACAAATGTCAATACGCATAACGTGATGCATATTACATAATTGAACTTTATTGC > 2:612530/1‑251 AATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATC < 2:44159/251‑1 GTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACA > 2:184619/1‑250 GTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGGTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAAC < 1:221515/250‑1 ATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCAAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTG > 2:112101/1‑251 TGATTAAATAAAGGGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTGCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTAGTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGT < 1:552398/250‑1 AAATAAATTGTCGAGTTTTGGATTGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTTTCCGCAA < 2:372609/251‑1 AAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACG < 1:313842/250‑1 GCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAA > 1:148053/1‑250 GCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACG > 2:365338/1‑204 GCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACG < 1:365338/204‑1 TATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGA < 2:159812/250‑1 CAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACC < 1:284746/250‑1 AGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACC > 1:207385/1‑251 ACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077344‑3077567‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACC > NC_000913/3079400‑3079632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |