| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,410,081 | 13624 bp→ATGC | yjfI–[ulaF] | 18 genes yjfI, yjfJ, yjfK, yjfL, yjfM, yjfC, aidB, yjfN, bsmA, yjfP, ulaR, ulaG, ulaA, ulaB, ulaC, ulaD, ulaE, [ulaF] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4410081 | 4423704 | 13624 | 57 [0] | [0] 57 | yjfI–[ulaF] | yjfI,yjfJ,yjfK,yjfL,yjfM,yjfC,aidB,yjfN,bsmA,yjfP,ulaR,ulaG,ulaA,ulaB,ulaC,ulaD,ulaE,[ulaF] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4410080 | 0 (0.000) | 55 (1.160) +ATGC |
48/488 | 0.0 | 100% | intergenic (+74/‑53) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/DUF2170 domain‑containing protein YjfI |
| ? | NC_000913 | 4423705 = | 0 (0.000) | coding (6/687 nt) | ulaF | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase UlaF | |||||
ATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTA > NC_000913/4423462‑4423953 | cgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTa > 1:5530‑M2/244‑250 (MQ=255) cgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggttcgccagcgcggctaatttctcagcattatgaacagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtacgataattacgtaatgcAACGCTAACacagcc > 2:146993‑M2/237‑250 (MQ=255) gctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAAcagc > 1:342663‑M2/236‑249 (MQ=255) gggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGaa < 1:26832‑M2/25‑1 (MQ=255) gcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGcc > 2:171652‑M2/223‑250 (MQ=255) ctgtaggtgaagggatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgcgttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgttgcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagacttatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagcgggaaagatatttacgtaatgcAAAGCTAACAATGCAGGTATTTgaagaca > 2:218207‑M2/222‑247 (MQ=255) cggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtacgataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGCATTTGAAGCCa > 2:91681‑M2/222‑250 (MQ=255) 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attacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCGTCTTCCGACACCGCGACGCATCTCGAActct > 2:92170‑M2/13‑251 (MQ=255) attacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAActct > 2:3326‑M2/13‑251 (MQ=255) cgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGGAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGGCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACcg < 2:190491‑M2/243‑1 (MQ=255) atgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGCAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATCTGAGCGGCAAGGTGGTGGCAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGCACTCTCCcgtcgt > 2:147026‑M2/5‑251 (MQ=255) gcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTa < 1:58990‑M2/249‑1 (MQ=255) | ATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTA > NC_000913/4423462‑4423953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |