| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,041,467 | A→G | K31K (AAA→AAG) | zinT → | metal‑binding protein ZinT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,041,467 | 0 | A | G | 98.6% | 246.5 / ‑5.6 | 71 | K31K (AAA→AAG) | zinT | metal‑binding protein ZinT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (25/45); minor base T (1/0); total (26/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
CCTCAAATCACCAAAATAATTTATTTTATTTCAATAAGATAGATAAGTAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGCAGATAAAACTAAAACATTTGCTGAAATTAAAGATTATTATCACAAAGGTTATGCAACAGATATCGAGATGATT > NC_000913/2041222‑2041698 | cgcggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCt < 1:162547‑M2/93‑1 (MQ=255) cggtcgtgctgggtacgggactgggtggagaaacattgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtacgggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGGCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCTCACGGCAAGCCCTTaa < 2:348952‑M2/96‑1 (MQ=255) ggtcttgctgggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTTGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAAc > 2:95639‑M2/155‑251 (MQ=255) gggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatctCGATTCGTCTTGACAATCGGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTGAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTc < 1:738533‑M2/104‑1 (MQ=255) gggtacgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTc < 1:220247‑M2/104‑1 (MQ=255) acgggactgggtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACaa < 1:30162‑M2/110‑1 (MQ=255) gtggagaaacactgtcgaagattgaatggctggcgctcggcgtaattgtcttcgcggtggtactggtcacgttgggaaaatatctcttcccggcaaaacccgtagttgcgccagttattcaggacgcatcaCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCGTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTa < 2:617688‑M2/120‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |