| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,139,771 | 10483 bp→TG | [ptsA]–[eptC] | [ptsA], frwC, frwB, pflD, pflC, frwD, yijO, [eptC] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4139771 | 4150253 | 10483 | 80 [0] | [0] 81 | [ptsA]–[eptC] | [ptsA],frwC,frwB,pflD,pflC,frwD,yijO,[eptC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4139770 | 0 (0.000) | 79 (0.740) +TG |
70/492 | 0.3 | 100% | coding (2452/2502 nt) | ptsA | putative PTS multiphosphoryl transfer protein PtsA |
| ? | NC_000913 | 4150254 = | 0 (0.000) | coding (12/1734 nt) | eptC | phosphoethanolamine transferase EptC | |||||
AGCACAGCGCCGCCAGAGAGGCCGCCCATAGCACCACGCCGATTACTGCGGCAATAATTTTAATCCGCTTCGGAAAGAGGAATACCGGGATCAACCACAGCGAACTGAATAACAGCGAGTCGCGAATGCCGTTAGTGCCACTATAACCACTGATGTAAATAATGGCCTGTAGCAGAGTAGAGAAAAACCAAAAGTAGAGCAGTGCCCAACCCAGGGCTTTCCAGCTAAAAAGAGGTTTAGCCTGGACTTCTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCGAATGTAACGACAATTCCTTAAGGATATCTGAAGGTATATTCAGAATTTGAATAAAATGCAGACAGAAATATATTGAAAACGAGGGTGTTAGAACAGAAGTATTTCAGAAAACCCTCGCGCAAAAGCACGAGGGTTTGCAGAAGAGGAAGATTAGCCGGTATTACGCATACCTGCCGCAATCCCGGCAATAGTGACCATTAACGC > NC_000913/4150004‑4150500 | gctcatggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgt > 1:28181‑M2/251‑251 (MQ=255) catggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgtgt < 1:228435‑M2/3‑1 (MQ=255) atggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgcttgcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgactgctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTgg < 2:682350‑M2/5‑1 (MQ=255) atggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTgg > 2:738078‑M2/247‑251 (MQ=255) ggtctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGaa < 2:304454‑M2/7‑1 (MQ=255) ctgagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagccgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggcgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGc > 2:758234‑M2/242‑251 (MQ=255) gagcaaacagaatgccctcatcaccaatcgcttttggcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccaggatgtttccttttccagttccagttcaggttgcagcaggctggcgataggggcggcagaggctgTGTGGAATGCAt < 1:624654‑M2/12‑1 (MQ=255) agcaaacagaatgccctcatcaccaatcgcgttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATa < 2:142561‑M2/13‑1 (MQ=255) gcaaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAg < 1:463577‑M2/14‑1 (MQ=255) caaacagaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGt > 1:427642‑M2/237‑251 (MQ=255) gaatgccctcatcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAAc < 1:574806‑M2/21‑1 (MQ=255) catcaccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCtt < 1:123287‑M2/28‑1 (MQ=255) caccaatcgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGaaa < 1:626427‑M2/32‑1 (MQ=255) atagctttgtgcagacgcggcagcacttcccatattgacgccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcccccgggcaatggggaatacgcgtgccagacgttcgtctgctgcgacgttagcggtgtccagatccagttccatgatgtgtccggttacagcaccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtctgcagaggctgTGTGGCATGCATAGTAAGACCTTGTCTTGAAAAAatat < 2:185854‑M2/38‑1 (MQ=255) cgctttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCg < 2:461287‑M2/40‑1 (MQ=255) tttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCg > 2:862146‑M2/209‑251 (MQ=255) ttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGcc < 1:633778‑M2/42‑1 (MQ=255) ttttgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCg < 1:265405‑M2/43‑1 (MQ=255) tgcagacgcggcagcacttcccatatggactccttgctggcagcgataatgctcgggttagttgtcaccccggcaatggggaatatgcgtgccagacgttcgacttctgcgacgttagcggtgtccagatacagttccatgatgtttccttttacagttccagttcatgttgcagcaggctggcgatagcgtcggcagaggctgTGTGGAATGCATAGTAAGAACCTGTCTTGAAAAAATATCGCCGAAt < 1:560077‑M2/46‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |