| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1455109 = | 132 (1.220) | 3 (0.030) | 3/496 | 8.0 | 2.0% | coding (242/288 nt) | paaB | phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase subunit B |
| ? | NC_000913 | 4019841 = | 166 (1.530) | coding (218/606 nt) | ubiJ | ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiJ | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGTTATAAGTTCTGACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGATCGCCAGCAGCTTACCGCACTGATTCGCAGTGGTGAGCTGGAAGTGCAGGGCGATATTCAGGTGGTGCAAAACTTCGTTGCGCTGGCAGATCTGGCAGAGTTCGACCCTGCGGAACTGCTGGCCCCTTATACCGGTGATATCGCCGCTGAAGGAATCAGCAAAGCCATGCGCGGAGGCGCAAAGTTCCTGCATCACGGCATTAAGCGCCAGCAACGTTAT > NC_000913/4019596‑4020091 | ggTTATAAGTTCTGACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTAc < 1:743276/250‑1 (MQ=255) tCTGACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGtt > 2:780834/1‑251 (MQ=255) gACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAACCAGCCCGCTCGCGGCTGCTGGGGAAAGTATTGCGCGTGGCGGGAAAAGGCTTTTCGACGTCATTTATTCCGGTGTTCAGCGAACGCCAGGATGATGTACTGGGGGAATGGGCAGGCGATGCGGTCGGCACCGTTATCGCCTACGCCAGGGTGCTGcc > 2:610186/1‑251 (MQ=255) gACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGcc < 1:398463/251‑1 (MQ=255) gACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGCATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGGGTGTTGcc > 2:409611/1‑251 (MQ=255) aGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGGGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGGGTTGCCGa > 2:653220/1‑250 (MQ=255) gaCCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTCACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACtt > 2:347284/1‑251 (MQ=255) aCCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTc > 1:521427/1‑251 (MQ=255) cGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTcgc > 1:657906/1‑251 (MQ=255) ggAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGGATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGGTCAGCGAACGACAGGATGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGGGGGGTGCCGAAACTTcgcc > 2:96670/1‑250 (MQ=255) aaaTGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACTCCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCGCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGAt < 2:312157/251‑1 (MQ=255) aaTGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAACGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGATc < 2:222214/251‑1 (MQ=255) aTGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGGCATTGATTCTGGTGTTCAGCGACCGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGATCg > 2:382217/1‑251 (MQ=255) 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aGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGATCGCCAGCAGCTTACCGCAc > 1:402357/1‑251 (MQ=255) gTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGGTTTGCCGAAACTTCGCGATCGCCAGCAGCTTACCGCACt > 2:5187/1‑251 (MQ=255) gACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACGTCGCGATCGCCAGCAGCTTACCGCACTg < 1:739391/250‑1 (MQ=255) 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GGTTATAAGTTCTGACAGGAGACCGGAAATGCCTTTTAAACCTTTAGTGACGGCAGGAATTGAAAGTCTGCTCAACACCTTCCTGTATCGCTCACCCGCGCTGAAAACGGCCCGCTCGCGTCTGCTGGGTAAAGTATTGCGCGTGGAGGTAAAAGGCTTTTCGACGTCATTGATTCTGGTGTTCAGCGAACGCCAGGTTGATGTACTGGGCGAATGGGCAGGCGATGCTGACTGCACCGTTATCGCCTACGCCAGTGTGTTGCCGAAACTTCGCGATCGCCAGCAGCTTACCGCACTGATTCGCAGTGGTGAGCTGGAAGTGCAGGGCGATATTCAGGTGGTGCAAAACTTCGTTGCGCTGGCAGATCTGGCAGAGTTCGACCCTGCGGAACTGCTGGCCCCTTATACCGGTGATATCGCCGCTGAAGGAATCAGCAAAGCCATGCGCGGAGGCGCAAAGTTCCTGCATCACGGCATTAAGCGCCAGCAACGTTAT > NC_000913/4019596‑4020091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |