| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,060,444 | Δ19,761 bp | yihL–yiiF | 19 genes yihL, yihM, yihN, ompL, yihO, yihP, yihQ, yihR, yihS, yihT, yihU, yihV, csqR, yihX, yihY, dtd, fabY, yiiE, yiiF |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4060444 | 4080204 | 19761 | 49 [0] | [0] 50 | yihL–yiiF | yihL,yihM,yihN,ompL,yihO,yihP,yihQ,yihR,yihS,yihT,yihU,yihV,csqR,yihX,yihY,dtd,fabY,yiiE,yiiF |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4060443 | 0 (0.000) | 49 (0.960) | 44/490 | 0.1 | 100% | intergenic (+213/‑4) | bipA/yihL | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA/putative DNA‑binding transcriptional regulator YihL |
| ? | NC_000913 | 4080205 = | 0 (0.000) | intergenic (+236/+94) | yiiF/fdhE | protein YiiF/formate dehydrogenase formation protein | |||||
AGGAATGGTAATGGGAAAAAATGATGTCAATCAGATTGCTGACAACGTGCGCGTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAGTCGTATAAATTCAATGTATTGCAGTTTATTGGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATCTTACGCTTGTCATCAGTCTCATGCCCATAACCTTATTGATGTGGTGGTGGGTAAATTGAGGCCAAACCGGCACTGGCGGCATAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGTCG > NC_000913/4079959‑4080455 | cgccgcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCtt < 1:126187‑M2/4‑1 (MQ=255) cgcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAgg > 2:130785‑M2/244‑251 (MQ=255) gcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAggt > 1:235057‑M2/243‑251 (MQ=255) cgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtagctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAggtg < 2:307424‑M2/10‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |