| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,795,656 | Δ5,717 bp | glaR–[nrdE] | glaR, kbp, yqaE, ygaV, ygaP, stpA, alaE, ygaC, ygaM, nrdH, [nrdI], [nrdE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2795656 | 2801372 | 5717 | 62 [0] | [0] 62 | glaR–[nrdE] | glaR,kbp,yqaE,ygaV,ygaP,stpA,alaE,ygaC,ygaM,nrdH,[nrdI],[nrdE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2795655 | 0 (0.000) | 62 (1.210) | 51/490 | 0.0 | 100% | intergenic (+2/‑19) | gabP/glaR | 4‑aminobutanoate:H(+) symporter/DNA‑binding transcriptional repressor GlaR |
| ? | NC_000913 | 2801373 = | 0 (0.000) | coding (409/411 nt) coding (26/2145 nt) |
nrdI nrdE |
dimanganese‑tyrosyl radical cofactor maintenance flavodoxin NrdI ribonucleoside‑diphosphate reductase 2 subunit alpha |
|||||
CGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGCTTCTGGTAATCGCAACTTTGGTGAGGCGTATGGCCGCGCCGGAGATGTGATTGCCCGGAAATGCGGCGTGCCGTGGCTGTACCGTTTTGAACTCATGGGTACGCAAAGCGATATCGAAAACGTTCGTAAAGGAGTAACCGAATTTTGGCAACGACAACCGCAGAATGCCTGACGCAGGAAACGATGGATTACCACGCGCTGAATGCGATGCTTAACCTCTACGATAGCGCAGGTCGCATTCAGTTCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGTGTGACCTTCAGTAGCCAGCAGCAGCGCCTGAACTGGCTGGTCAACGAAGGTTACTATGATGAAAGCGTTCTTAATCGCTACTCTCGCGACTTTGTCATTACGCTGTTT > NC_000913/2801125‑2801614 | cgcaaaattctgcgagcagaaggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGa < 1:216730‑M2/3‑1 (MQ=255) tgcgagcagacggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggatttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtggtctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgcccattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaaaccccgttcataatacgcgctggtcTGACGCAGGAAAc > 2:321808‑M2/239‑251 (MQ=255) gcgagcagaaggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaacagctggtattgtggccaaaaacaaccgttcataataccagctgatcTGACGCAGGAAACg > 2:64480‑M2/238‑251 (MQ=255) cagaaggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAACGATgg > 1:216070‑M2/233‑250 (MQ=255) agaaggaagcgaaattcgctttcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAACGATGGAt < 1:70013‑M2/20‑1 (MQ=255) agaaggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctgggattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAAAGATGGAt > 1:338799‑M2/232‑251 (MQ=255) aggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAACGATGGATTAc < 1:176224‑M2/23‑1 (MQ=255) ggaagcgaaattcgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctgggattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAACGATGGATTAcc > 1:353903‑M2/228‑251 (MQ=255) cgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgttcgtcgcaacagttagaagtgatctccaccggcttattagcgatagggattagctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcatactacgcgctgatcTTACGCCGGAAACGGTGGATTGCCACGCGCTGAAt < 2:378928‑M2/35‑1 (MQ=255) cgcttgcgaatgtggctttatccgtggctcacctggctagtcatcggctttattacctttgtgttggtagtgatgctattccgtccggcgcaacagttagaagggatctccaccggcttattagcgatagggattatctgtaccgtgccaattatggctcgctggaaaaagctggtattgtggcaaaaaacacccgttcataatacgcgctgatcTGACGCAGGAAACGATGGATTACCACGCGCTGAAt < 2:403570‑M2/35‑1 (MQ=255) 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gcgctgatcTGACGCAGGAAACGATGGATTACCACGCGCTGAATGCGATGCTTAAACTCTACGATAGCGCAGGTCGCATTCAGTTCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGTGTGACCTTCAGTAGCCAGCAGCAGCGCCTGAACTGGCTGGTCAACGAAGGTTACTATGATGAAATCGTTATTAATCGCAACTCTAGCGACTTTGTCATTACGCTGttt > 1:433193‑M2/10‑251 (MQ=255) | CGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGCTTCTGGTAATCGCAACTTTGGTGAGGCGTATGGCCGCGCCGGAGATGTGATTGCCCGGAAATGCGGCGTGCCGTGGCTGTACCGTTTTGAACTCATGGGTACGCAAAGCGATATCGAAAACGTTCGTAAAGGAGTAACCGAATTTTGGCAACGACAACCGCAGAATGCCTGACGCAGGAAACGATGGATTACCACGCGCTGAATGCGATGCTTAACCTCTACGATAGCGCAGGTCGCATTCAGTTCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGTGTGACCTTCAGTAGCCAGCAGCAGCGCCTGAACTGGCTGGTCAACGAAGGTTACTATGATGAAAGCGTTCTTAATCGCTACTCTCGCGACTTTGTCATTACGCTGTTT > NC_000913/2801125‑2801614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |