| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 62 [0] | [1] 63 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 62 (1.210) | 55/490 | 0.0 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
GAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTT‑AGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGC > NC_000913/3866087‑3866576 | gggcacggctggctcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGAt < 2:427494‑M2/9‑1 (MQ=255) ggcacgggtggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGAtt < 2:106706‑M2/10‑1 (MQ=255) gcacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGAttt < 2:286961‑M2/11‑1 (MQ=255) ggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacagtggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctgtcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTtata < 1:203197‑M2/19‑1 (MQ=255) gctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGca < 1:312455‑M2/24‑1 (MQ=255) gtggtcgtgggtctgcaaacctttggtgccggcgtgcgggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggtgttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctgtctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccacgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGcac < 2:222642‑M2/25‑1 (MQ=255) ggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGcac < 1:219913‑M2/25‑1 (MQ=255) ggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACAt > 2:37108‑M2/225‑251 (MQ=255) ggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaacccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgatggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttgagcgcacgccaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgctcGAAGCAGATTTGACTTATAGCGCACATTATc > 2:22584‑M2/221‑251 (MQ=255) ggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATc < 1:179445‑M2/31‑1 (MQ=255) ggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcacgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACg < 1:262647‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcatcctggggttgttgatgtccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgctcgtcaccgcagcatcgtcatcagctccgtgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCGCGGGaa < 2:182786‑M2/38‑1 (MQ=255) gcaaaactttgttgccggcgggctggcgtcgcgctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCAcgggg < 2:236755‑M2/37‑2 (MQ=255) 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aaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagt > 1:320783‑M2/163‑250 (MQ=255) aaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGTAATTTAACGCATTGTTGagta > 2:208455‑M2/162‑250 (MQ=255) gtcagggccgcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGCAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACCTTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGagtaagta > 1:29389‑M2/157‑249 (MQ=255) 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gcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTT‑AGCTATGTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTa < 1:137006‑M2/214‑1 (MQ=255) catcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTT‑AGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCaa < 1:339150‑M2/220‑1 (MQ=255) ccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTT‑AGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTa < 1:298590‑M2/229‑1 (MQ=255) 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GAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTT‑AGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGC > NC_000913/3866087‑3866576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |