| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 52 [0] | [0] 52 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 52 (1.010) | 43/492 | 0.1 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| ? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase | |||||
CACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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ACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGC < 2:62557/251‑1 GAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATAC < 1:367105/221‑1 GAGGGGTAGATAGGGAGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATAC > 2:367105/1‑221 ATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTTGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAACCAgtttcc > 1:418716/1‑244 GGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACAGTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCAAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGC < 1:298775/251‑1 AATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGAC < 1:449806/251‑1 TTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGAAGTAATCTTCATC > 1:128456/1‑251 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gcTACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTAACATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCGGTCGGCGGTAATCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCCTCGTCGAACATCGCTTCGTCGTCACCCGCGTCTTTCGCGGCACCCTGATac > 2:50320/3‑249 TACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCAAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCa > 1:390415/1‑248 ACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGGGTCTTTCGCGGCACCCTGATCCcgg > 2:325460/1‑248 TTCTAAAAAAACACCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGAA > 1:138206/1‑250 CACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2985593‑2985841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGAA > NC_000913/3033611‑3033857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |