Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,113,177 | 0 | A | G | 99.0% | 399.1 / NA | 104 | intergenic (‑116/+257) | rfbB/galF | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase 1/UTP:glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase, low activity |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (52/51); minor base T (0/1); total (52/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCAAGTGATTCCCGGTTTCCGGCGTACGTTAATTTATCGACATTAACAACACTATCCTGCGTATTATTTATAATGTGACGAACTACAGCTGAACCAATAAATCCTGCGCCACCAGTAACAAGTATTTTCACTTAATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCATGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCGTTGTTATTCTGATGGTTTATATAAAACAACGGCAGGAAGATTCGCAACAAATTACTTTTGCTGCGAATTTTCACTGCCGTTATAATTTTCTTATCAACCGTTACATCCGG > NC_000913/2112931‑2113422 | gcttggacattaattcttcctgtcaggttgaatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaattttcgcaaataagtatgcaaagttcttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttttTTATTCTATATTACTTCAGAGCATGCTGTAAAATAAGCGGCTCTCGGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTTGCTTTACAGCTACCAGAGCACtgcgtgc < 2:713732‑M2/114‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |