| Read alignment evidence... | |||||||||||
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ATGATAATGGCCTGAAAGCAGGAACGCGTTTTCCGGATGGGCTGGAATTAATTGAACATATTCCCCAGGGG‑CATAAAGTCGCATTGCTGGACATTCCGG‑CTAATGGTGAAATTATTCGTTA‑TGGCGAAGTGATTGGTT‑ACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAA‑T‑GGTTGTACTACCGG‑AA‑GCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTAC > NC_000913/3275367‑3275852 | aTGATAATGGCCTGAAAGCAGGAACGCGTTTTCCGGATGGGCTGGAATTAATTGAACATATTCCCCAGGGG‑CATAAAGTCGCATTGCTGGACATTCCGG‑CTAATGGTGAAATTATTCGTTA‑TGGCGAAGTGATTGGTT‑ACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAA‑T‑GGTTGTACTACCGG‑AA‑GCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCtt > 1:600033/1‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) gggacgcgcCGCCGTTCCACACGCTGCCACTGGCAACCAAATCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGAGCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTAc < 1:281740/246‑1 (MQ=255) g‑AA‑GCGCCCCCGTTCCACCCGCGGCCAGTGGCACCCAAAGTCCGGGACCCCTCACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACgg < 2:724020/251‑1 (MQ=255) ggccgccGTTCCCCACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTtgt < 1:838149/250‑1 (MQ=255) 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ggccccGGAACCCTTACCGCCGCTGGAATGATACCCCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTTTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTAc < 1:906577/248‑1 (MQ=255) | ATGATAATGGCCTGAAAGCAGGAACGCGTTTTCCGGATGGGCTGGAATTAATTGAACATATTCCCCAGGGG‑CATAAAGTCGCATTGCTGGACATTCCGG‑CTAATGGTGAAATTATTCGTTA‑TGGCGAAGTGATTGGTT‑ACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAA‑T‑GGTTGTACTACCGG‑AA‑GCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAT‑CATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTAC > NC_000913/3275367‑3275852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |