Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,664,896 | 0 | T | G | 28.5% | 336.2 / 23.1 | 138 | G169G (GGT→GGG) | yfhR | putative peptidase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ATGCCGGAAATATGTCCGCCCACTGGCCGCTGGTCAGTTGGTTACCCGAGCGTAATTTCAACGTTTTTATGTTTGATTATCGCGGGTTTGGTAAATCAAAAGGCACGCCGTCCCAGGCCGGATTGCTGGACGATACGCAAAGTGCCATCAATGTGGTGCGCCATCGCAGTGATGTAAACCCACAACGTCTGGTGCTGTTCGGGCAGAGTATTGGCGGGGCGAATATTCTGGATGTTATT‑GGTCGGGGTGATCGTG‑AAGGCATACGTGCGGTGATCCTCGACTCCAC‑ATTTGCCTCTTATGCAACCATCGCCAACCAAATGATCCCCGGCAGTGGCTACTTACTTGATGAGAGTTACAGCGGCGAAAATTATATCGCCAGCGTCAGCCCGATCCCGCTTTTACTCATTCACGGTAAAGCTGATCACGTTATCCCATGGCAGCACAGCGAAAAGTTGTATAGCCTGGCAAAAGAGCCAAAACGGTTGATCCTAATCCCG > NC_000913/2664649‑2665145 | gCCGGAAATATGTCCGCCCACTGGCCGCTGGTCAGTTGGTTACCCGAGCGTAATTTCAACGTTTTTATGTTTGATTATCGCGGGTTTGGTAAATCAAAAGGCACGCCGTCCCAGGCCGGATTGCTGGACGATACGCAAAGTGCCATCAATGTGGTGCGCCATCGCAGTGATGTAAACCCACAACGTCTGGTGCTGTTGGGGCGGAGTATTGGCGGGGCGAATATTCTGGATGTTATT‑GGTCGGGGTGATCg < 2:653915/251‑1 (MQ=255) 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ATGCCGGAAATATGTCCGCCCACTGGCCGCTGGTCAGTTGGTTACCCGAGCGTAATTTCAACGTTTTTATGTTTGATTATCGCGGGTTTGGTAAATCAAAAGGCACGCCGTCCCAGGCCGGATTGCTGGACGATACGCAAAGTGCCATCAATGTGGTGCGCCATCGCAGTGATGTAAACCCACAACGTCTGGTGCTGTTCGGGCAGAGTATTGGCGGGGCGAATATTCTGGATGTTATT‑GGTCGGGGTGATCGTG‑AAGGCATACGTGCGGTGATCCTCGACTCCAC‑ATTTGCCTCTTATGCAACCATCGCCAACCAAATGATCCCCGGCAGTGGCTACTTACTTGATGAGAGTTACAGCGGCGAAAATTATATCGCCAGCGTCAGCCCGATCCCGCTTTTACTCATTCACGGTAAAGCTGATCACGTTATCCCATGGCAGCACAGCGAAAAGTTGTATAGCCTGGCAAAAGAGCCAAAACGGTTGATCCTAATCCCG > NC_000913/2664649‑2665145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |