| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 442737 | 142 (1.120) | 3 (0.020) | 3/478 | 12.5 | 2.1% | coding (1189/1449 nt) | thiI | tRNA uridine 4‑sulfurtransferase |
| ? | NC_000913 | 1263044 = | 134 (1.060) | coding (457/624 nt) | lolB | outer membrane lipoprotein LolB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CAGCGTGTGGTAACCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCAATTTGCCAATCATCTCTTCGGCGTCATCGGCGGTATAACGCTGACCTTTATTGTCGACTAACTGC‑ACGTT‑ACCCGGTTGAGCATTCAGCTCCAGTTCCGTGCTGCCCAATGGGTTAGTGAGCAGC‑AGACGGTAGCGATCCTGGCCGGTTTGCTGCCAGAAAAAGC > NC_000913/1262794‑1263292 | cAGCGTGTGGTAACCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGgtc < 1:186973/251‑1 (MQ=255) gtgtGGTAACCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTcc < 1:437913/251‑1 (MQ=255) gTAACCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATTGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTGCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGttt < 2:163512/251‑1 (MQ=255) aCCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGt > 1:626907/1‑250 (MQ=255) cATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAg < 1:40118/243‑1 (MQ=255) cATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGt < 2:122788/251‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCAt < 1:516097/251‑1 (MQ=255) gACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATc < 2:868969/249‑1 (MQ=255) gTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGttt > 2:820191/1‑229 (MQ=255) gTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGttt < 1:820191/229‑1 (MQ=255) gTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGt > 1:683346/1‑251 (MQ=255) aaTGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTa < 1:344838/250‑1 (MQ=255) tataAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAAcc < 2:668407/250‑1 (MQ=255) 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cAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGt > 2:349453/1‑213 (MQ=255) cAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATcc > 1:649624/1‑250 (MQ=255) aTTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTg > 2:138136/1‑251 (MQ=255) 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cTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGCATTGGCATTCCGGTCAATTTGcc > 2:753570/1‑250 (MQ=255) gTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCAATTTGCCAatcatcc > 2:68479/1‑250 (MQ=255) aTCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGTATTCCGGTCAATTTGCCAATCATCTCtt < 1:486158/251‑1 (MQ=255) 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1:625396/251‑1 (MQ=255) tGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGGTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCAATTTGCCAATCATCTCTTCGGCGTCATcggcg > 1:1001603/1‑251 (MQ=255) gCGTCGACCACCGTCGGTGAGTTCCATAGTGGCCGGCATCTCAGGTTGCGTTTTGGCGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGCACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCCATTTGCTAATCATCTCTTCGGCGTCCTCGGCGGtat < 1:383850/251‑1 (MQ=255) gTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCAATTTGCCAATCATCTCTTCGGCGTCATcggcggggta > 2:792140/1‑246 (MQ=255) 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CAGCGTGTGGTAACCATCCGCACGCTGACCGGTAATGTATAAAAACAGATTAAGTTTTGCCGGAGAGGGCCACTGTGTCCGCATTATTTCACTATCCAGTTATCCATTTTTAACTTGATGCGTTGACCACCGTCGGTGAGTTCCATATTGGCTGGCATCGCAGGTTGCGTTTTGGTGTCATAACCACCATAAACAACCTTCCAGTTTTTGCCATTCTGGCTGTAGGTAATTTCGCTCAGGCGGTACTGGTCGTCCAGTTTGTAGTCGGTTGCATCACCCGGTAAACCTAAAATCCACTGGCGCAAGCTGTTGAGCGGAATTGGCATTCCGGTCAATTTGCCAATCATCTCTTCGGCGTCATCGGCGGTATAACGCTGACCTTTATTGTCGACTAACTGC‑ACGTT‑ACCCGGTTGAGCATTCAGCTCCAGTTCCGTGCTGCCCAATGGGTTAGTGAGCAGC‑AGACGGTAGCGATCCTGGCCGGTTTGCTGCCAGAAAAAGC > NC_000913/1262794‑1263292 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |