New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 418803 = | 141 (1.110) | 3 (0.020) | 3/478 | 12.5 | 2.0% | coding (915/1296 nt) | phoR | sensor histidine kinase PhoR |
? | NC_000913 | 2812840 = | 155 (1.220) | coding (225/1539 nt) | emrB | multidrug efflux pump membrane subunit EmrB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CGCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTC > NC_000913/2812590‑2813086 | cGCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAgcgc < 2:473337/251‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGcgcg < 1:24918/251‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCAGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGagcg > 2:576281/1‑251 (MQ=255) cTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGt > 1:543440/1‑251 (MQ=255) tAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGCACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCg > 2:149457/1‑248 (MQ=255) tAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGTTGGCTGGCAAAGCGCGTCg < 1:149457/248‑1 (MQ=255) ccAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCAGCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGt < 2:277133/251‑1 (MQ=255) gagGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGa > 1:342363/1‑250 (MQ=255) gTGCTTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCTCCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACt < 2:568131/251‑1 (MQ=255) gCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTg < 1:612808/250‑1 (MQ=255) 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cAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTc > 2:884892/1‑251 (MQ=255) aCCGCTGGAAGGCGCGCAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCt < 1:348037/251‑1 (MQ=255) gcgcAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTg < 1:541258/247‑1 (MQ=255) cAACTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTg < 1:549228/251‑1 (MQ=255) aaCTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTgg > 2:1034311/1‑251 (MQ=255) aaCTGGTCATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGCCGGGGAAGTGAAACTGTTCCCTTGTTCCCCCATCGCCTTTGCGATTGCGTCGTgg > 2:990530/1‑251 (MQ=255) gggcATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCgt < 1:905773/248‑1 (MQ=255) catcaTGACGCTTGGGCTGTCCCTGATGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCCCTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCCGGGAACGTGGGTAATCACTTCCTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGGGAAAATGTTCACTTGGTCCCCCATCGCCTCTGCCATTGAGTCGTGGGCgtggg > 2:301957/5‑249 (MQ=255) cATTATGACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCgtgt < 1:173555/250‑1 (MQ=255) gACGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCCCCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGtct > 2:216568/1‑251 (MQ=255) cGATTGCGCTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTcc > 1:582280/1‑251 (MQ=255) cgcTGTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTAGTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCagcagc < 1:355974/251‑1 (MQ=255) gTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCTTCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTGGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTg < 1:942348/250‑1 (MQ=255) gTCACTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGa < 1:156992/182‑1 (MQ=255) aCTGGCGACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGGGGTGTCTCCAGCAGCCTGAat > 1:953883/1‑250 (MQ=255) gACATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTg > 1:396708/1‑250 (MQ=255) cATTCATGCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGAtc > 1:289181/1‑251 (MQ=255) gCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCttcttc < 2:342363/250‑1 (MQ=255) gCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTcc < 1:521602/251‑1 (MQ=255) gCAGGTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTcc < 1:478145/251‑1 (MQ=255) ggTGCTGGACTCCTCCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAatat < 2:59650/234‑1 (MQ=255) ggTGCTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAatat > 1:59650/1‑234 (MQ=255) cTGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGAtc > 2:605866/1‑237 (MQ=255) tGGACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGAtt > 1:893081/1‑251 (MQ=255) ggACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGGATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGAt < 2:190231/249‑1 (MQ=255) ggACTCCACCATTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTc < 1:368449/251‑1 (MQ=255) ccaTTGCTATCGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGAtt < 2:1022009/251‑1 (MQ=255) ccaTTGCTAACGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGAtt < 1:554801/251‑1 (MQ=255) aaCGTGGCGATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGcc < 2:977541/249‑1 (MQ=255) gATCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTg > 2:92558/1‑250 (MQ=255) tCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGtt < 2:11762/136‑1 (MQ=255) tCCCCACTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGtt > 1:11762/1‑136 (MQ=255) cccACTCTCGCCGGGAATCTTGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTCGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATccc < 2:1056234/251‑1 (MQ=255) ccacgttCGCCGGGAATCGGGTGTGATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGGTCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGGGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCg < 2:424291/245‑1 (MQ=255) ccTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCt < 2:893081/250‑1 (MQ=255) cTATCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCtt > 1:857745/1‑251 (MQ=255) atatgggcGGGAATCTGGGTGCATGGCTCAGCCAGTGAACGTGGGTAATCACTTTTTTCGGGGTGGCTAAGGCCATCTCGATCCCGCTTTTCGGCTGGCTGGCAAAGCGCTTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTTTGTTGTCTCCATCAGCCTGAATATGCTGTTCTTCTTCCGCGTGGGTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATcccacc < 2:670272/243‑4 (MQ=255) aTCGCCGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTc < 1:613943/251‑1 (MQ=255) ccGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCaa < 2:439159/251‑1 (MQ=255) ccGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCaa < 2:289181/251‑1 (MQ=255) ccGGGAATCTGGGCTCATCGCTCAGCCAGGGAACGTGGGTAATCACTTCTTTCGGGGTGGCGAATGCCATCTCGATCCCGCTTACCGGCTGGCTGGCAAAGCGCGTCGGGGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCa > 2:232987/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |