| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1811315 | 151 (1.190) | 3 (0.020) +C |
3/476 | 12.5 | 2.0% | coding (382/1392 nt) | tcyP | cystine/sulfocysteine:cation symporter |
| ? | NC_000913 | = 4014805 | 138 (1.090) | coding (1753/2262 nt) | metE | cobalamin‑independent homocysteine transmethylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAATCCGACGTCAATTATCAGCGTGGTAATTTTTGCCGCATTCCTCGGCGTAGCTGCATTGAAACTGCTGAAGGATGATGCG > NC_000913/1811070‑1811560 | cccTGCCTACCATTTATAGTTCTGACAGCCAGCTACTTAATGATCCTGCACAGTCGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCACCTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTAAGCGCGGTTCCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCCAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCCCGCTGATGGCGCCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCACCCTg > 2:321406/1‑251 (MQ=255)cccTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTg > 1:1051633/1‑251 (MQ=255)cccTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTg > 1:223513/1‑251 (MQ=255) gCATTCCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTTCAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGTCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAATTCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTGTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTgttt < 2:949603/250‑1 (MQ=255) tATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGc > 1:406274/1‑251 (MQ=255) tATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGc > 1:913478/1‑251 (MQ=255) cAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg > 2:653485/1‑251 (MQ=255) aGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt > 1:121707/1‑251 (MQ=255) cAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTcc > 1:1006227/1‑250 (MQ=255) ggTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAgg < 2:798009/251‑1 (MQ=255) ggTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAgg < 1:1017233/251‑1 (MQ=255) aCTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggt < 1:776942/250‑1 (MQ=255) tAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGgtggtg > 1:548115/1‑251 (MQ=255) aaaGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGc < 1:803363/251‑1 (MQ=255) aaGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGc > 1:701724/1‑250 (MQ=255) aCAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCAc > 2:87728/1‑251 (MQ=255) aGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGt < 1:738238/251‑1 (MQ=255) ggTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGTAAGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTATGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGATTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGATCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTg > 2:693173/1‑251 (MQ=255) ggTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTg > 1:353749/1‑251 (MQ=255) aaCATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCATCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGCAACTGCACGTCTGAACGc > 2:922268/1‑251 (MQ=255) cGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTg < 1:951754/251‑1 (MQ=255) cGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTg < 1:974967/251‑1 (MQ=255) gTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggtggt < 2:1058578/218‑1 (MQ=255) gCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTAt > 2:984978/1‑251 (MQ=255) aTGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGtt < 2:387850/251‑1 (MQ=255) aTGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGGAACTATGtt < 1:706071/251‑1 (MQ=255) gTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTg < 2:559343/250‑1 (MQ=255) aaCTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTaa > 2:408557/1‑250 (MQ=255) 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cAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCtctg > 1:568296/1‑250 (MQ=255) aaaTGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCtctgat > 2:1001011/1‑251 (MQ=255) aTCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTATATTCTGAGCGCGGTTGCCAGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGCTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCAAGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGACAGTAACTATGTTGGTAAAGTCtctgcactg > 2:750291/1‑244 (MQ=255) 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CCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAATCCGACGTCAATTATCAGCGTGGTAATTTTTGCCGCATTCCTCGGCGTAGCTGCATTGAAACTGCTGAAGGATGATGCG > NC_000913/1811070‑1811560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |