New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 898481 = | 90 (0.710) | 3 (0.020) | 3/478 | 12.5 | 2.4% | intergenic (+4/‑37) | ybjO/rlmC | putative inner membrane protein/23S rRNA m(5)U747 methyltransferase |
? | NC_000913 | = 3344179 | 149 (1.170) | coding (236/726 nt) | lptB | lipopolysaccharide transport system ATP binding protein LptB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGCCGGTGTCAGGCCCGGAACAAGGGTTTCGTAATAAAGCCAAAATGGTGGTGAGTGGTAGCGTTGAAAAACCACTG > NC_000913/898234‑898730 | ggCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGtat < 1:380548/250‑1 (MQ=255) gTTTTCACTGGGGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCGCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATCTG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGCCCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCCATAATGTGTATAAt > 2:149898/1‑251 (MQ=255) ttCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAAtcg < 1:208333/250‑1 (MQ=255) cggcTGGTGAAGGGGGGGCGCTGGCCGTTCTGGCTTTATCTGCTGACACAAACCGCCGCCGCAAGTGACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTGCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCGTCCAGTTGCAATAATGTGTATAAtcgt < 2:284076/247‑1 (MQ=255) gTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCt > 1:175089/1‑251 (MQ=255) gAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCtg‑a < 1:738823/251‑1 (MQ=255) aGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCtg‑atg > 1:226265/1‑250 (MQ=255) cGTCGCGGGGCGCGCTGGCTATATCTGCGGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGAtgtg < 1:98258/251‑1 (MQ=255) gTCGCTGGGCGCGTTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGcccc < 1:233986/240‑1 (MQ=255) gTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGcccc > 2:233986/1‑240 (MQ=255) gTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGAtgtg > 2:1059127/1‑250 (MQ=255) cGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGaa < 1:507779/250‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCTCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAg < 1:181410/250‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTCTAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGa > 2:181410/1‑248 (MQ=255) ggggcgctgtggtgatagcagcgtacacAAACCTCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACAGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGTCCAGTCTGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTc < 2:175089/227‑1 (MQ=255) gcgcgcTGGCTATATCTGCTGACACAAATCGCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTc > 2:392576/1‑248 (MQ=255) gcgcgcTGGCTATATCTGCTGACACAAATCGCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTc < 1:392576/248‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATg > 2:906490/1‑251 (MQ=255) gcTGGATATATCTGCTGACAAAAATCCCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCGTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTAt < 1:772613/251‑1 (MQ=255) ggCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGc < 1:646487/250‑1 (MQ=255) gCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGc > 2:702149/1‑249 (MQ=255) tatCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGATTCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CCCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATTTGTATAATCGTCGCCCCTG‑CTTATGTGAAGGTCAATATATCCAGGgcg > 2:806285/1‑251 (MQ=255) atCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTgcgc > 1:923208/1‑251 (MQ=255) ctgACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACttt > 1:702737/1‑251 (MQ=255) cggcccacagtCACCGCCGCAATTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGGACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAAGCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACttt < 2:716681/241‑1 (MQ=255) cggACACAAATCCCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCCGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCGTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACttt < 1:806285/249‑1 (MQ=255) acaAATCCCCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTacgac < 1:563537/251‑1 (MQ=255) acaAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAAtcgtcg > 1:594005/1‑205 (MQ=255) acaAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTacgac > 2:563537/1‑251 (MQ=255) accACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTGCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGTACTTTACTACGCgg < 2:333718/249‑1 (MQ=255) cccgccgCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTc < 1:702149/250‑1 (MQ=255) cccgccgCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTCCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTc < 2:44079/250‑1 (MQ=255) cgccgcAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGc > 2:644303/1‑251 (MQ=255) ccgcAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTg < 1:1045844/251‑1 (MQ=255) gcAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTc > 1:313145/1‑251 (MQ=255) aaGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGt > 2:708047/1‑251 (MQ=255) aaGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGt > 1:680449/1‑251 (MQ=255) gTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGAACGGTTATCAGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTACATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTACCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGCTGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTc > 1:143316/1‑251 (MQ=255) tACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTcc < 2:1051545/250‑1 (MQ=255) tgGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTccgt > 2:836648/1‑248 (MQ=255) 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gCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTg > 2:180264/1‑202 (MQ=255) gCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTg < 1:180264/202‑1 (MQ=255) ggggTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGc < 1:332961/249‑1 (MQ=255) ggggTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGc < 1:708047/249‑1 (MQ=255) gTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGAtt < 1:103253/251‑1 (MQ=255) cGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTacga > 1:948145/1‑205 (MQ=255) cGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTacga < 2:948145/205‑1 (MQ=255) ggTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTcc > 1:510024/1‑249 (MQ=255) ccGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAAc > 2:553096/1‑251 (MQ=255) cTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCCG‑AGCAACTCTCCg > 2:115311/1‑251 (MQ=255) cccGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACtctc > 1:233689/1‑237 (MQ=255) cccGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACtctc < 2:233689/237‑1 (MQ=255) tGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCtt > 1:298173/1‑251 (MQ=255) aaTCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCg > 1:1007004/1‑213 (MQ=255) aaTCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGAGGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCg < 2:1007004/213‑1 (MQ=255) aaaTCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGc > 2:537541/1‑251 (MQ=255) 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2:238898/1‑196 (MQ=255) aTAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTcc > 2:172231/1‑251 (MQ=255) aGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCgg > 1:796913/1‑251 (MQ=255) ccTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGtt > 2:741287/1‑251 (MQ=255) 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tGCCGGATATG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGcc > 2:865855/1‑251 (MQ=255) gCCGGTTATT‑CTCACCCTGTTGCTGCTGTTCGTTCCCGCGCCCGGTGGGCGTTTCTTCCAGTTGAAATAATGTGTTTAGTCGTCGCCC‑TGTATGATGTGAAGGTTAATGTATGCAGTGCCCTTTTTACGACGCGGTTCGCTGTCGTTCCTGTCAGGGGATAATGCGGCCGTTTCCAG‑AGCACCCCTCGGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGCCg < 2:226007/251‑1 (MQ=255) atG‑CTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTG‑ATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAG‑AGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGCCGGTGTc > 2:594291/1‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |