| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 232715 | 69 (0.880) | 3 (0.040) | 3/494 | 8.1 | 3.5% | coding (1241/1359 nt) | mltD | membrane‑bound lytic murein transglycosylase D |
| ? | NC_000913 | = 3844758 | 97 (1.230) | coding (795/1767 nt) | adeD | adenine deaminase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCG > NC_000913/3844510‑3845005 | cTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATCAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGACCTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGCAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAAccc > 2:463484/1‑249 (MQ=255) cAGAAATGATGGACTACCCTGGCAAAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGCAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGCACCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTg > 2:44807/1‑251 (MQ=255) aGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTgg > 2:282564/1‑251 (MQ=255) aaaTGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATTCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCa < 2:85650/251‑1 (MQ=255) ggACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTg < 2:623324/250‑1 (MQ=255) gACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGAt < 1:54794/251‑1 (MQ=255) cTACCCTGGCGTAATTAGCGCGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACGTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGCGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGATATTGAAAACTGCCACGAACGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATACGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCCCAACGCGCTGGCCCCGTTGATc > 2:358201/1‑250 (MQ=255) tACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTGGATCa > 2:402084/1‑250 (MQ=255) aCCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAAc < 1:321291/251‑1 (MQ=255) gaggaaTTAGAGGACAGAATGCTCAGATCGATAAAATGGATGCGATTCGCCACCGGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAACGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGGATTGAACACTGCACCGACAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCCTGTCGCTGATGATCCGAGAAGGATCGGCTGCCCGAAATCTCAACGCGCAGACAACGTTGATCAACGAAttt > 2:464293/5‑251 (MQ=255) 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gctgctCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGctct > 1:559426/1‑251 (MQ=255) ctgctCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTg > 2:27050/1‑251 (MQ=255) tgctCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGt > 1:619609/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |