Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 61 [0] | [0] 61 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 61 (0.780) | 54/494 | 0.3 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT |
GGTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2030202‑2030450 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGC > NC_000913/2041379‑2041625 gggTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGGAATGTCAGGCCGGCGCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCGCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAC < 2:293296/247‑1 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ACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGG < 2:90724/249‑1 ttaccaTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTCCTGGGTACGGGACTGGGTGGCGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCCCGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCCCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATC > 1:442693/7‑250 GTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTTGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCA > 2:138859/1‑249 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GTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACA < 1:616559/251‑1 GGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAA > 1:404619/1‑250 GGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCT < 2:400168/249‑1 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ACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGTCGTAATTGTCTTCGCGGGTGTACTGGTCACGTTGTGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTT < 2:341028/251‑1 GTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTAGGCGTAATTGTCTTCGCGGCGGAACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTGGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCGCCTGCCTTTTCGCATGGTCCTCACTCACACGGCAAGCCATTAGCAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAAAGGGGTTTTTG > 2:621697/1‑250 TCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGATGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACGCACACGGCAAGCCCTTAACATAGGTCGCACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGAT > 1:290668/1‑251 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TTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCT > 1:461744/1‑242 TTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCT < 2:461744/242‑1 CCGGCAAATCCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCGTTACTGCAAAGT < 2:168158/251‑1 CCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGT > 2:334125/1‑251 CGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTT‑GATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGG < 2:101728/251‑1 AAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCA > 2:108328/1‑250 atCCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCGTTATTGTTAGCGCTCCTGCCCTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCACTTAACAGAGGTCGAATAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTATTGCAAAGTTGCAAAt < 2:393245/249‑2 CCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTG < 1:236694/251‑1 AGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACC < 1:191166/250‑1 gccgtTTATTCAGTACGCATCACGATTCGTCTTTATAAACTGGCTGTTGCTTTAGTTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTTCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGTCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAACAAGCTGCTAATGGTGTTTGTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCGATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAATGGCAAACTTGACCCCGTCTT < 2:254638/246‑1 CAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTTTCTTTATTGTTAGCTCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGTCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGTTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAAAAGAA < 1:621697/250‑1 ACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGG < 1:193703/251‑1 GCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGAT < 1:244274/251‑1 CATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATG > 1:598221/1‑251 ATCACGATTCGTCTTTCCAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGGCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGC < 2:496438/251‑1 GGTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2030202‑2030450 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGATGC > NC_000913/2041379‑2041625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |