| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 48 [0] | [0] 49 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 48 (0.800) | 42/494 | 0.3 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| ? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase | |||||
CTACCGCGCCACCGATCCGAGTGGCATTGTGGAAAATGAAGTGTGTCCGGTATTTGCCGCACGCACCACTAGTGCGTTACAGATCAATGATGATGAAGTGATGGATTATCAATGGTGTGATTTAGCAGATGTATTACACGGTATTGATGCCACGCCGTGGGCGTTCAGTCCGTGGATGGTGATGCAGGCGACAAATCGCGAAGCCAGAAAACGATTATCTGCATTTACCCAGCTTAAATAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGAAGCG > NC_000913/3033373‑3033860 | accaattaacagtgcaatagtaaatgattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaaccccccaatagaggggtagatagtgcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCg < 1:285386‑M2/13‑1 (MQ=255) atagtaaatgattgttaattacagttatctgaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaaccctccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTtg < 2:136640‑M2/29‑1 (MQ=255) tagtaaatgattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTtgt > 1:130087‑M2/222‑251 (MQ=255) aattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATg > 1:162994‑M2/207‑251 (MQ=255) tacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCtt > 2:25771‑M2/204‑251 (MQ=255) tatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTAtttt < 2:342542‑M2/53‑1 (MQ=255) cttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagacagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCg > 2:345378‑M2/195‑251 (MQ=255) aaaagtgatttttatcacaaagtaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaacccctaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATGTTACCGGACGCATCGCCggg < 1:258639‑M2/71‑1 (MQ=255) aaagtgatgtttatcacaaaggcaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaatggccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAAGGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGa < 2:5342‑M2/72‑1 (MQ=255) aagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACAGGACGCATCGCCGGGa > 2:265292‑M2/179‑250 (MQ=255) aagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcaatcagagacataactggctcgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgcccgccattctgtttaagttgtagatgttacgttcTAAAAAAACCCCGACAGTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATGTTAGCGGACGCAGCGCCGGGaa < 2:408724‑M2/73‑1 (MQ=255) ttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAAc > 2:90679‑M2/170‑251 (MQ=255) aaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGt < 2:162994‑M2/94‑1 (MQ=255) gagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTgttt > 2:218500‑M2/148‑250 (MQ=255) gagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGtt < 1:218500‑M2/103‑1 (MQ=255) agtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGACCAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAAc > 1:102069‑M2/141‑250 (MQ=255) agagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGGGAACAGCAt > 2:499112‑M2/137‑251 (MQ=255) agagacataacgggcccgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCAt < 1:258956‑M2/115‑1 (MQ=255) gacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATGACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTTGGGAACAGCATTAc > 2:18539‑M2/134‑251 (MQ=255) acataactggcacgtcgggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTAcc > 2:395201‑M2/133‑251 (MQ=255) ataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggtgtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCAt < 2:330042‑M2/121‑1 (MQ=255) agggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATAcc > 1:185554‑M2/118‑250 (MQ=255) 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accactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGAc > 1:208105‑M2/108‑251 (MQ=255) ccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTcg > 2:52686‑M2/99‑251 (MQ=255) atagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGt > 1:417027‑M2/93‑250 (MQ=255) 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atggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGGAATCTTCATCGTAGAACATCGc > 1:475626‑M2/47‑251 (MQ=255) gtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTtc < 1:438233‑M2/208‑1 (MQ=255) gtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTtc < 2:484105‑M2/208‑1 (MQ=255) 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agatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTg > 1:62005‑M2/14‑251 (MQ=255) gttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGaa < 1:90679‑M2/247‑1 (MQ=255) cTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGGCTTTCGCGGCAACCTGATCCCGGAAGCg > 2:29961‑M2/2‑251 (MQ=255) | CTACCGCGCCACCGATCCGAGTGGCATTGTGGAAAATGAAGTGTGTCCGGTATTTGCCGCACGCACCACTAGTGCGTTACAGATCAATGATGATGAAGTGATGGATTATCAATGGTGTGATTTAGCAGATGTATTACACGGTATTGATGCCACGCCGTGGGCGTTCAGTCCGTGGATGGTGATGCAGGCGACAAATCGCGAAGCCAGAAAACGATTATCTGCATTTACCCAGCTTAAATAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGAAGCG > NC_000913/3033373‑3033860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |