| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 39 [0] | [0] 40 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 39 (0.650) | 37/494 | 0.4 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
| ? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT | |||||
GGTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAAGCGAGTAAATGAATCCCCTGCGTGTCGATCTGCGCGCTGGCACCTTCGCCGCAGATCCACTCTTCCAGACGCTCGGTAAGCGCTTCATCCGTCAGCTTCTCGCGCCCACGTAACGCGCACTCCCAGACAATCAATACGCGCCAGCCGAGTTCCTGCAAGCGACTGATATCGCGGCGATCGCGCTCAACATTTTTACCTATCTTCTCCAGCCAGAACTCGGTTCGAGTCGCAGGCACTTTAAA > NC_000913/2030202‑2030693 | ggTTCGATGATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGGCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCGGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAc < 2:261916‑M1/250‑2 (MQ=255) ccATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttaca < 2:62851‑M1/251‑16 (MQ=255) gTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTGCGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttaatgt < 1:423662‑M1/250‑47 (MQ=255) gTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGCAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgtt > 1:352049‑M1/1‑204 (MQ=255) cGGCTCTCGCCCCCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctc < 2:500432‑M1/251‑55 (MQ=255) gCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACTGGACTGGGTGGATAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGTCGTAATTGTTTGCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAATCCCGTCGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCActattcttctttacaaactggctgttgctttaggtgtcgttattgttagcgctcct < 1:126489‑M1/251‑57 (MQ=255) tctcGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgc > 1:115818‑M1/1‑193 (MQ=255) ccaccaGCTACGCTTACGTTAAACCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgcctttt > 1:207275‑M1/1‑188 (MQ=255) caccaGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACGGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttc < 2:40946‑M1/251‑65 (MQ=255) caGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgca < 1:186227‑M1/251‑68 (MQ=255) caGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGAATGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATATCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGAACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgc > 1:466672‑M1/1‑184 (MQ=255) aGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcat > 1:72048‑M1/1‑183 (MQ=255) cGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCGTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtca < 1:340890‑M1/251‑74 (MQ=255) cTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctaccttttcgcatggtcatc > 2:357761‑M1/1‑176 (MQ=255) aCGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcact < 1:23658‑M1/251‑79 (MQ=255) aCCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacg < 1:37289‑M1/251‑85 (MQ=255) gtggtCGCGGTCTTGGTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTAGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTAGTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtcgttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaag < 2:196858‑M1/251‑90 (MQ=255) ggTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaac < 1:235191‑M1/251‑98 (MQ=255) ggACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaa < 1:413262‑M1/251‑114 (MQ=255) gACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaag < 1:27302‑M1/251‑115 (MQ=255) ggTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaagtcggacaaaaagctgct > 1:298385‑M1/1‑132 (MQ=255) gcgAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGTACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgttgttgat < 1:276401‑M1/250‑135 (MQ=255) cGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATAAcgattcgtctttacaaactggttgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatccctcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgag < 1:276414‑M1/250‑135 (MQ=255) aTTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgcc > 1:356323‑M1/1‑111 (MQ=255) tGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgcca > 2:482370‑M1/1‑109 (MQ=255) gAATGGCTGGCGCTCGGAGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaat > 2:125728‑M1/1‑108 (MQ=255) aaTGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatg < 1:464948‑M1/251‑145 (MQ=255) aTGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgt > 1:123265‑M1/1‑106 (MQ=255) ggctggcGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtac < 1:444539‑M1/251‑148 (MQ=255) gcTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccg > 1:19428‑M1/1‑97 (MQ=255) cGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTTGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAATCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATTAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaa < 2:266380‑M1/250‑157 (MQ=255) gCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgc > 1:329975‑M1/1‑92 (MQ=255) gctgtgatactggtcACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTTCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgatttgtctttacaaactggctgttgctttagatgtctttattgttagcgctgctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgttcaaaaccgaacgctcagtgactgggat < 2:273296‑M1/244‑174 (MQ=255) ggtggtACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatgg < 1:90161‑M1/251‑176 (MQ=255) gggAAAATATCTCTTCCCGGCACGACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAAGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagcggtcgaacaaaacgctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttt > 2:214865‑M1/1‑58 (MQ=255) aaaTATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaacttgctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcct < 2:313641‑M1/251‑198 (MQ=255) ctTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgc > 1:468802‑M1/1‑46 (MQ=255) aGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttatttttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccgtctttc > 1:213379‑M1/1‑19 (MQ=255) aCGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccgtctttcagaagaaagcgg < 1:357761‑M1/251‑244 (MQ=255) | GGTTCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAAGCGAGTAAATGAATCCCCTGCGTGTCGATCTGCGCGCTGGCACCTTCGCCGCAGATCCACTCTTCCAGACGCTCGGTAAGCGCTTCATCCGTCAGCTTCTCGCGCCCACGTAACGCGCACTCCCAGACAATCAATACGCGCCAGCCGAGTTCCTGCAAGCGACTGATATCGCGGCGATCGCGCTCAACATTTTTACCTATCTTCTCCAGCCAGAACTCGGTTCGAGTCGCAGGCACTTTAAA > NC_000913/2030202‑2030693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |