Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,164,363 | 0 | A | C | 27.0% | 193.7 / 12.5 | 101 | G537G (GGT→GGG) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/22); new base C (1/26); total (52/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CCTTACCTGCACGGTTACGCGCCACCAGATCGTTAAAGGTGCAGACGAAACCGTAACCCGCATCGGAAGCCATCAGCAGTTTCTGATCGTCGCTTTCCATCAGCATATGGTCAAC‑GGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGC‑AGCGTAATCGGG‑TCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCCCGGCGCGTCGATATCATGGCCTTTAGCGCTGCGTACCCAGCCCATCTGCGACAGCACAATGGTGACAGGTTCAGACGGCAGCATGTCGTGCTCGCTCATCGCTTTCGCTTCTTCGCGTTCCTGCAACGGCGAACGACGATCGTCACCGTAGGCTTGCGCGTCTGCCTGCAGTTCTTTCTTCAGCAGGTTATTCATTTTACG > NC_000913/3164116‑3164611 | ccTTACCTGCACGGTTACGCGCCACCAGATCGTTAAAGGTGCAGACGAAACCGTAACCCGCATCGGAAGCCATCAGCAGTTTCTGATCGTCGCTTTCCATCAGCATATGGTCAAC‑GGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGC‑AGCGTAATCGGG‑TCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCt > 1:552915/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |