| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1020187 = | 37 (0.540) | 3 (0.040) | 3/492 | 5.8 | 3.7% | intergenic (‑134/+223) | ompA/sulA | outer membrane protein A/cell division inhibitor SulA |
| ? | NC_000913 | = 1127330 | 118 (1.720) | coding (525/924 nt) | yceM | putative oxidoreductase YceM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CGATAAACCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGTTTGCCGAGCACCATTTTTCGGCTGGTCCTTTGCAGATCACCACCTGTATGCATCGCCGTGCCGGAAGTCAGCGTGAAACCGTGCAGGCCGTGACTGACGGTGCGCTCATCGACATTACGGATATGCGCGAATGGCGTGAGGAGCGCGGGCAGGGCGTAGTGCATAAACCGATTCCTGGTTGGC > NC_000913/1127081‑1127577 | cGATAAACCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTg < 1:581674/250‑1 (MQ=255) gATAAACCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTggc > 2:418197/1‑249 (MQ=255) aTAAACCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCg > 1:150637/1‑251 (MQ=255) aaaCCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGCTTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCggg > 1:428534/1‑251 (MQ=255) aaCCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAAAAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGggc > 2:546698/1‑251 (MQ=255) aCCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGggcg < 2:85459/251‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCAGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGggcg > 2:479237/1‑251 (MQ=255) aGAAAATCTGCGCGATGCTGAACGGCTGGAGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCct > 1:468179/1‑251 (MQ=255) gcgcGAAGCTGAACGGCTGGGGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCCTTTCGCACCACTCTACGGTGAATTAAAAACGCAACTCGCCCCCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTg < 1:540003/247‑1 (MQ=255) gcgATGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGc > 1:134978/1‑251 (MQ=255) ggaggcggAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACGGACGTTGATGGTCGGTTTGAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACTCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTGATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCg < 2:215040/244‑1 (MQ=255) aTGCTGAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGt < 1:480905/251‑1 (MQ=255) gAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACg < 1:567408/249‑1 (MQ=255) gAACGGCTGGTGGAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCt < 2:172725/251‑1 (MQ=255) ggtggAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACt < 2:112739/250‑1 (MQ=255) ggAACTGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGGCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAACCATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAacg > 2:430344/1‑251 (MQ=255) tGGCGGCGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTACCCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTCTTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGcc > 2:183520/1‑250 (MQ=255) ggcggcGCGGAAAAAACTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTg > 1:495934/1‑251 (MQ=255) ggagcgGAAAAAACTGACGTGGATGGTCGGTTTTAGCCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACACGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTTGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCg < 1:89581/248‑1 (MQ=255) aaaaaCTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGCAATGCTg > 2:375212/1‑251 (MQ=255) aaaaCTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGGGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTCCTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGt > 2:470706/1‑251 (MQ=255) aaaCTGACGTTGATGGTCGGTTTTAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGtt > 2:555680/1‑251 (MQ=255) 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cGGTTTTAACCGTCGTTGCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTAGCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGTTTGCCGAGCACCAttttt < 2:213103/251‑1 (MQ=255) ttttAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGTTTGCCGAGCACCATTTTTCgg > 2:508483/1‑251 (MQ=255) tttAACCGTCGTTTCGCACCACTCTACGGTGAGTTAAAAACGCAACTCGCCACCGCAGCCTCGCTAAGAATGGATAAACATCGTAGCAATAGCGTCGGGCCACACGATCTTTATTTCACGTTGCTGGATGATTATCTGCATGTGGTGGATACCGCGCTGTGGTTGTCGGGCGGCAAAGCCTCTCTGGATGGCGGTACGCTACTGACTAACGACGCTGGCGAAATGCTGTTTGCCGAGCACCATTTTTCGGc > 1:515811/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |