| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 707186 = | 120 (0.860) | 3 (0.020) | 3/492 | 10.4 | 1.8% | coding (1094/1665 nt) | glnS | glutamine‑‑tRNA ligase |
| ? | NC_000913 | 4290802 = | 202 (1.450) | coding (327/957 nt) | nrfD | putative menaquinol‑cytochrome c reductase subunit NrfD | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GTATTTCTGCTGGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACGCCCGTTCATCGCGGACTGGAAACATTGATGCTGGTGCTGGCGGTGTTGTT‑GGGGGCTTATACCGGCTTTCTGCTGTCGGCGCTGAAATCGTATCCGTTCCTCAATAACCCGATCCTGCCGGTGCTGTTCCTCTTCTCCGGCATCTCGTCC > NC_000913/4290552‑4291051 | aTTTCTGCTGGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctggtgc < 1:584716/250‑1 (MQ=255) ttCTGCTGGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCtgt > 1:198633/1‑251 (MQ=255) ttCTGCTGGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCtgt > 1:521495/1‑251 (MQ=255) tCTGCTGGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCtgt < 1:853454/250‑1 (MQ=255) ctgctgGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGGCAGTACGGTGCTGCGCCCCACGCTGATTGTCGGGGCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTTGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGCCCTTCTGGACGCTGCTGTTACTCTGCAGTTTTACCTCGGGTATGTCGATGGGGGGGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTTCTGGTGCTGtgg > 2:378231/1‑251 (MQ=255) tgctgGTCTGGTGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCCGACCGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGAGGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCGGGTGCTGgggc > 2:1039885/1‑251 (MQ=255) ggtctggtGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCATCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggctggc < 1:22747/251‑1 (MQ=255) ggtctggtGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggctgg < 2:744114/250‑1 (MQ=255) ggtctggtGACGCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggctg < 1:288659/249‑1 (MQ=255) gCTGGCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTg > 1:387666/1‑251 (MQ=255) ggCCGTGCTGTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGa < 1:1042242/249‑1 (MQ=255) gTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCCCCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttg < 2:125673/250‑1 (MQ=255) gTTACGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCCGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCCCTACAGTTTTACCTCGGTGATGGCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTCCATGGTGGGGCTGGTGCTGTGGCTGGCGGAAATATTTGAACATGGTttgc > 2:658450/1‑251 (MQ=255) gTTACGTCGCGTCTTCCCGCAGGCGGGCGGGGCAGACATTACGGTGCTGCGCTCCACGCGGATTGCCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGGCTGTTTATCCTCGTCGTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGAGGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGAttt < 2:540727/249‑1 (MQ=255) aCGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttgcttg < 1:132387/251‑1 (MQ=255) aCGTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttgctt < 1:100251/250‑1 (MQ=255) gTCGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGcc < 2:181993/251‑1 (MQ=255) cGCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACAGGATTTGCTTGCCCt < 2:360170/251‑1 (MQ=255) gCTTCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTTCTTGCCCTg > 1:1161655/1‑251 (MQ=255) tCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGTTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCTCCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGGTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGc < 2:1146833/249‑1 (MQ=255) tCTACCCGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGGCGGGCGCGGGGATACTCGGTCTGTTGATCCTAGTATTCCACCTGACAAGAACGTGGAACTTCTGGAAGCCGATGGTCCACTAAAGTTTTACCTCGGGGATATCGATGGGGGTGATGCTGTTTCCGCTCTACATGGTGGAGCTGGTGCTGTGGCTGGAGACAATCTTTGAACATAGTttgctggaactgaa > 2:1063945/1‑241 (MQ=255) cccGCAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGGCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCaacaac < 2:77626/251‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTg < 1:733748/251‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCGGTGCAGACAGGACGTTGCTGCGCCCCCCGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTTCCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGaaaa < 1:824958/214‑1 (MQ=255) aGGCGGGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACCTGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGTTTTGCTTGCCCTGCACCAACGcggg > 2:648964/1‑248 (MQ=255) cgggcggTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTg > 2:204400/1‑251 (MQ=255) cgggcggTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCAACACGATGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGAGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTg > 1:437064/1‑251 (MQ=255) gCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTTCCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCt < 2:994094/251‑1 (MQ=255) aGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTgg > 1:831232/1‑251 (MQ=255) gACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTggg > 1:1114064/1‑251 (MQ=255) aGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGAt < 1:716772/251‑1 (MQ=255) aCGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCCACAACGCTGGATGCCGAAGCTGGGGaacgc > 2:661404/1‑247 (MQ=255) ggtggctgcGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTg < 2:1152116/247‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCGCCCCACGCTGAGTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTg < 1:563054/251‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGATGCCGAAGCTGGGGATCGTg < 1:937175/251‑1 (MQ=255) gttgatgcgcactcctttGATTGTCGGGCTGGGCGCGGTGATTGTCGGTCTGTTGATCATCGGCTTCCATCTGACATGACCGGGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATTTCGATGGGGGTGATTCTGTGTCAGCTCTACATGGTGGTGTTGGTGCTGTGGCTGGTGTAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCTCCGAAACAACGCTGGGGGTCGAAGCTGGGTATCGTGc < 2:313266/234‑1 (MQ=255) cgcACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGTCCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGt < 2:340199/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |