| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,245,234 | 0 | G | T | 31.6% | 98.4 / 16.5 | 57 | L25F (TTG→TTT) | ycgY | uncharacterized protein YcgY |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCATAAGGCGGATAGCGATACAGATGCCGCTATCCGCTTTCACATCAGAACGTATACTCGACACCTGCTTTACGGGTGAAAAAAATCAATATAGCACTTCGATATCCGATAAAGTCGGTTCCCGGTAACAACAACAGAATCCTTTTTTAATTATTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGG‑TTTTGGCTGCGCTTATT‑G‑AACATTTAGAATTGATCAAT‑CCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAG‑TTACGCG‑AAGAGGAA‑T‑GG‑TCTGAATTCTTTTTTT‑GGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAACGTTGATGAGTGAACA‑CCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGT > NC_000913/1244988‑1245474 | tCATAAGGCGGATAGCGATACAGATGCCGCTATCCGCTTTCACATCAGAACGTATACTCGACACCTGCTTTACGGGTGAAAAAAATCAATATAGCACTTCGATATCCGATAAAGTCGGTTCCCGGTAACAACAACAGAATCCTTTTTTAATTATTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATGTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGG‑TTTTGGCt < 1:227182/250‑1 (MQ=255) 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gAGGCGG‑TTTTGGCTGCGCTTATT‑G‑AACATTTAGAATTGATCAAT‑CCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAG‑TAACGCG‑AAGAGGAA‑T‑GG‑TCTGAATTCTTTTTTT‑GGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAACGTTGATGAGTGAACA‑CCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAAc < 1:575066/250‑1 (MQ=255) aGGCGG‑TTTTGGCTGCGCTTATT‑G‑AACATTTAGAATTGATCAAT‑CCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAG‑TTACGCG‑AAGAGGAA‑T‑GG‑TCTGAATTCTTTTTTT‑GGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATCATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAACGTTGATGAGTGAACA‑CCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGAGGCTTTATATAGCCAACGt < 1:95679/251‑1 (MQ=255) | TCATAAGGCGGATAGCGATACAGATGCCGCTATCCGCTTTCACATCAGAACGTATACTCGACACCTGCTTTACGGGTGAAAAAAATCAATATAGCACTTCGATATCCGATAAAGTCGGTTCCCGGTAACAACAACAGAATCCTTTTTTAATTATTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGG‑TTTTGGCTGCGCTTATT‑G‑AACATTTAGAATTGATCAAT‑CCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAG‑TTACGCG‑AAGAGGAA‑T‑GG‑TCTGAATTCTTTTTTT‑GGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAACGTTGATGAGTGAACA‑CCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGT > NC_000913/1244988‑1245474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |