Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,579,757 | 0 | C | A | 27.6% | 133.0 / 22.8 | 76 | C345F (TGC→TTC) | ydeM | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme YdeM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/20); new base A (0/21); total (35/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.39e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGT‑TATTAATTATTCTCCATTT‑GTTTTGCAA‑CATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCA‑TGGCGTTCATATAA‑GGTACCA‑TGGTTGAAAAAA‑GGATTTTATAACCTT‑CGCAAAAATAAGAAACAGTCTCATTGTTTACTTTAGTAAT‑ACGATGCTTAGGACAACCGCCATTGCAGATAGGTTTATATGCACATTGCTGACATTTCGCTGGAATCCGTTTT‑TTTTGCGCTGTCAGTTGTACACTGTTCATCGTTTTGAGTTCAGATTTATTAATGTTTCCAATTTTGTACTGTGGATAGACAAAATGGTCGCATTCGTAAATGTCTCCATTACTTTCAACAACC > NC_000913/1579513‑1579990 | gTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGT‑TATTAATTATTCTCCATTT‑GTTTTGCAA‑CATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCA‑TGGCGTTCATATAA‑GGTACCA‑TGGTTGAAAAAA‑GGATTTTATAACCTT‑CGCAAAAAt > 1:353419/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |