| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 63 [0] | [1] 64 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 63 (1.280) | 58/488 | 0.0 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
TAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGC‑AAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGC > NC_000913/3866090‑3866576 | cacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTg > 1:169135‑M2/240‑251 (MQ=255) ccggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGc < 2:279841‑M2/13‑1 (MQ=255) ggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCt < 1:352164‑M2/15‑1 (MQ=255) tggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgattaagcgcacgtcacagcagcatcgtcatcagctacatgggagaacgatgctgcttGAGGCAGATTTTCCTtat > 2:39909‑M2/234‑251 (MQ=255) cgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggcgaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAgcgc > 2:188316‑M2/229‑251 (MQ=255) ggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGcaca < 1:304699‑M2/26‑1 (MQ=255) ggtggtggtcggaaagccattggttccgtcgtgctggcgtcggtctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagccgggggttgttgatgaccttaatgggattggtgatcgtgctgtgctggcggccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtgtaagcgcacgtcaccgcagcatcttcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAACATATTTGCCTTATATCGCTCAtt < 2:320555‑M2/28‑1 (MQ=255) tctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACggg > 2:197736‑M2/216‑251 (MQ=255) gcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGaa > 1:373874‑M2/213‑250 (MQ=255) caaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGaa > 1:95073‑M2/212‑249 (MQ=255) aaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcggcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggctgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGaa > 2:280101‑M2/211‑248 (MQ=255) acattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACg > 1:172241‑M2/208‑251 (MQ=255) ccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAat < 1:86724‑M2/53‑1 (MQ=255) gtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCtt > 1:278156‑M2/194‑251 (MQ=255) gtggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagccgggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTaaa < 2:397219‑M2/61‑1 (MQ=255) ggcgtcgctctctgcgatgtggccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgcccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACa < 1:435803‑M2/63‑1 (MQ=255) 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cagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaaa > 1:92359‑M2/150‑250 (MQ=255) agcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACaaaaa > 2:56590‑M2/149‑250 (MQ=255) gttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCccac > 1:50603‑M2/141‑251 (MQ=255) 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TAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGC‑AAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGC > NC_000913/3866090‑3866576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |