Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 536,173 | T→C | L155P (CTC→CCC) | hyi → | hydroxypyruvate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 536,173 | 0 | T | C | 100.0% | 141.5 / NA | 40 | L155P (CTC→CCC) | hyi | hydroxypyruvate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (19/21); total (19/21) |
ATTGCCTGTATTCCTGGCCGTGAAGAAGAGTTTCGGGATGGCGTAGCAGCAGCGATTCGTTATGCCCGTGCGCTGGGTAATAAAAAAATTAACTGTCTGGTCGGTAAAACGCCGGCTGGTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAAACCTGCGTTATGCCGCGAATATGCTGATGAAAGAAGATATTTTATTACTGATTGAACCTATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTCCATCTCACCGGAACTCGGCAGGCGCTGAAATTGATTGATGATGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTATCATATGCAGCGGATGGAAGGTGAATTAACCAACACCATGACTCAGTGGGCTGATAAAATTGGTCACCTGCAAATTGCCGATAATCCGCATCGCGGCGAACCGGGAACCGGAGAAATTAATTATGATTATCTCTTTAAGGTAATCGAAAATTCTGACTACAACGGTTGGG > NC_000913/535926‑536418 | aTTGCCTGTATTCCTGGCCGTGAAGAAGAGTTTCGGGATGGCGTAGCAGCAGCGATTCGTTATGCCCGTGCGCTGGGTAATAAAAAAATTAACTGTCTGGTCGGTAAAACGCCGGCTGGTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAAACCTGCGTTATGCCGCGAATATGCTGATGAAAGAAGATATTTTATTACTGATTGAACCTATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTCCATCCCAc > 1:391708/1‑251 (MQ=255) 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cGCCGGCTGGTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAAACCTGCGTTATGCCGCGAATATGCTGATGAAAGAAGATATTTTATTACTGATTGAACCTATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTCCATCCCACCGGAACTCGGCAGGCGCTGAAATTGATTGATGATGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTa > 1:46240/1‑214 (MQ=255) tGGTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAACCCAGCGTTATGCCGCGAATATGCTGATGAACGAAGCTATTCTATTACTGATTGACACTATTAACCATTTTGATATTCCTGCTTTCCATCCCACCGGAACTCGGCAGGCACTGAAattg > 1:485782/1‑160 (MQ=255) tGGTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAAACCTGCGTTATGCCGCTAATATGCGGATGGAAGAAGATATGTTATTACTTAGTGAACCTATTAACCATTTTGAAATGCCTGGTTACCATCCCGGCGGAACTCTGCAGGCGCTGAAattg < 2:485782/160‑1 (MQ=255) gTTTCAGCAGTGAACAGATTCACGCAACGCTTGTAGAAAACCTGCGTTATGCCGCGAATATGCTGATGAAAGAAGATATTTTATTACTGATTGAACCTATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTCCATCCCACCGGAACTCGGCAGGCGCTGAAATTGATTGATGATGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTATCATATGCAGCGGATGGAAGGTGAATTAACCAACACCATGACTc > 1:134941/1‑249 (MQ=255) 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attaCTGATTGAACCTATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTACACCCCACCGGAACTCGGCCGGCGCTGAAATTGATTGATGCTGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTATCATATGCAGCGGATGGAAGGTGAATTAACCAACACCATGACTCAGTGGGCTGATAAAATTGGTCACCTGCAAATTGCCGATAATCCGCATCGCGGCGAACCGGGAACCGGAGAAATTAATTATGAtt > 1:216729/1‑251 (MQ=255) tATTAACCATTTTGATATTCCTGGTTTCCATCCCACCGGAACTCGGCAGGCGCTGAAATTGATTGATGATGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTATCATATGCAGCGGATGGAAGGTGAATTAACCAACACCATGACTCAGTGGGCTGATAAAATTGGTCACCTGCAAATTGCCGATAATCCGCATCGCGGCGAACCGGGAACCGGAGAAATTAATTATGATTATCTCTTTAAGGTa > 1:5979/1‑250 (MQ=255) tGATATTCCTGGTTTCCATCCCACCGGAACTCGGCAGGCGCTGAAATTGATTGATGATGTTGGTTGCTGCAATTTGAAAATTCAGTATGACATTTATCATATGCAGCGGATGGAAGGTGAATTAACCAACACCATGACTCAGTGGGCTGATAAAATTGGTCACCTGCAAATTGCCGATAATCCGCATCGCGGCGAACCGGGAACCGGAGAAATTAATTATGATTATCTCTTTAAGGTAATCGAAAATTCTg > 2:255746/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |