Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 64 [0] | [0] 64 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 63 (1.110) | 57/486 | 0.1 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB |
CCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTTATCAGATCACGCATCACCCGCATATGCGGTGCGGAGTAAGAATAAAACGCCTGATAGCCCGCACAAAGCACGCTGTCTGGCGTCTCCTGCCGAGCGTGCGGGCACAGGCGATGCCAGTCGCACGCCTGGCAGTCACAGCGCGGTTGCGGGTTTTCGCTGCCACACCATTTTTGTAAGGTGGCGTCAAAAAGCTCAATCGAGATACGACTGATATCTGCCCGCACCCAACACTCGAAC > NC_000913/3854911‑3855396 | ccTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGTCCTTAAGGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCGGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCTGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTga < 1:331861‑M1/250‑3 (MQ=255) ggCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagca < 1:308105‑M1/251‑7 (MQ=255) ggtgCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATGGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCGCTGCGATGGTGCCGCAAACCGGTCAGGTTAGGCTGGGGTTGTTGATGACCGTAATGGGAGGGTTGATCGTGCGGTGCGGGGTGCGGCGGGCGGCGGGGATGTGGCATCAGGTGCAGCCTGTTTAAGCGCACGTC‑GGCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCttgaagcaga < 1:255552/248‑9 (MQ=255) gggCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagat < 1:4918‑M1/251‑10 (MQ=255) ggCTGGCGCGCTGGACGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgacgcagatttgcct > 1:93231‑M1/1‑236 (MQ=255) ggTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacat > 1:182149‑M1/1‑224 (MQ=255) gTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacatt < 1:92752‑M1/251‑29 (MQ=255) gggtCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGGTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTGTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATTCTGGTTgaagcagatttgcctgatagcgcacattatcac < 2:512056‑M1/250‑34 (MQ=255) tGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGACGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacggga > 2:265142‑M1/1‑213 (MQ=255) aTTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtg < 1:438934‑M1/251‑47 (MQ=255) ggCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGAGGTTGCCGCAAACCGGTCAGCGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatat > 1:296657‑M1/1‑196 (MQ=255) ggCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaac > 1:432857‑M1/1‑188 (MQ=255) cGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagt < 1:497835‑M1/251‑66 (MQ=255) cGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcgtaaacagtcg < 1:398620‑M1/250‑68 (MQ=255) tctGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaattt > 1:396679‑M1/1‑178 (MQ=255) ctGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagctttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaattt > 1:347467‑M1/1‑177 (MQ=255) aTGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGCACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgcaatatcttaaacagtcgaaatttaacgc > 1:255551‑M1/1‑172 (MQ=255) gCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGGATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGGGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgctgaaatatcttaagcagtcgaaatttaacgcattgtt < 1:191693‑M1/251‑85 (MQ=255) gCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgt < 1:379960‑M1/250‑84 (MQ=255) cGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑CCCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgg > 2:166763‑M1/1‑165 (MQ=255) aaaacggtcAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagta < 1:145505‑M1/247‑90 (MQ=255) cGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTCATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagt > 2:471117‑M1/1‑158 (MQ=255) gTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagta > 1:166608‑M1/1‑156 (MQ=255) cAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGAGTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCGGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGGTTgaagcagttttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatagcttaaacattcgaaatttaacgcattgttgagtagtaagacaaaaaa < 1:340269‑M1/251‑103 (MQ=255) ggggTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccc > 2:157910‑M1/1‑143 (MQ=255) gatgaCCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaac < 1:291928‑M1/177‑44 (MQ=255) gatgaCCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaac > 2:291928‑M1/1‑134 (MQ=255) gatgaCCGTACTGGGATGCTTGATCGTGCGGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCCTCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCAC‑TCAACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgagatgtaacgcattgttgagtaagtaacacaaaaaaagccccaccagact < 2:484558‑M1/251‑118 (MQ=255) gagggccttaatGGGATTGTTGATCGTTCTTTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGAGGTCGCATCAGGGGCAGCCCGGTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaat < 2:296657‑M1/246‑118 (MQ=255) atgaCTTTGATGTGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCTCTTGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTTCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgtcttagagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaattatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatg < 2:460886‑M1/251‑119 (MQ=255) atgaCCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatg < 1:265142‑M1/251‑119 (MQ=255) aCCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcg > 2:102174‑M1/1‑130 (MQ=255) ttAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGGGAAGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGAGAACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCCGCTCCATGGGAGAACGATGCTGGTTgtagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgcgccgaaatatcttaaaaattcgaaatttaaggcattgttgattaagtacgacaaaaaaagccacaccagaatggcggtg > 2:73160‑M1/1‑127 (MQ=255) gggATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcgggggcacg > 2:389906‑M1/1‑122 (MQ=255) gATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagag < 2:396679‑M1/251‑132 (MQ=255) ttgATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcgggggaaagagaaa > 1:150808‑M1/1‑115 (MQ=255) gATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagct > 1:407688‑M1/1‑113 (MQ=255) cGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaattgcggggcaaagagaatagctagt < 2:463589‑M1/251‑142 (MQ=255) gtgctgagctGGCTGCCGCTACAGACGCGGATGTCGCCACAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCACCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcaagggagagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaacgccccaccagaatggcgggggcaaggcacacgcgtgat > 2:352908‑M1/1‑109 (MQ=255) tgtgctgGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaat < 2:13634‑M1/239‑135 (MQ=255) tgtgctgGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaaaagagcggaaa > 1:13634‑M1/1‑105 (MQ=255) gtgctgGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagc < 2:150808‑M1/249‑146 (MQ=255) gtgctgGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatgtaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagc < 2:432857‑M1/249‑146 (MQ=255) ggctgCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaa < 1:528525‑M1/251‑153 (MQ=255) gCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGGGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatgtgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcg < 2:187936‑M1/251‑157 (MQ=255) gCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatctgaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcg < 1:471117‑M1/251‑157 (MQ=255) ccgcaggggacgcggatGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGGC‑ACCGCAGCAGCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacaggatcacgggaaagaacgtgcagaaatatcttaaacagtcgaaatgtaacgcagtgttgagtaagtaatacaaaaaaagccccaccagaagggcggggcaaagagaatagctatttagctatgtaacgcgg < 2:505431‑M1/243‑158 (MQ=255) cGACGGGGATGTCGCCTCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttc < 1:528935‑M1/251‑165 (MQ=255) cGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttc < 1:149999‑M1/251‑165 (MQ=255) aCGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgc > 1:493573‑M1/1‑85 (MQ=255) gggCAGCCCGTGTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcg < 2:346437‑M1/251‑185 (MQ=255) ccGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctaggtatctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgcggcgat < 1:86368‑M1/251‑192 (MQ=255) cGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCTTCGTCATCAGCTCCATGGGATAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcccattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatg < 1:22084‑M1/251‑193 (MQ=255) aGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggttca < 2:200796‑M1/251‑199 (MQ=255) gcgcACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggttcag < 2:182149‑M1/251‑200 (MQ=255) cACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaataggtagttagctatttaacgcggggcgttcgctgatggcgatacgctgcggtgcgatggggtccggct > 1:258543‑M1/1‑49 (MQ=255) c‑ACCGCAGCATCGTCAGCAGCGCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagagttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctattgaacgcgggacggtcgctgatagcgatacgctgcgcggcgatgggttcaggctcatt < 2:255551‑M1/250‑207 (MQ=255) ccGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGTGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatgtcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgcggcgatgggttcaggctcattacg < 1:283872‑M1/251‑210 (MQ=255) cagcaTCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacaggcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttggctatttatcgcgggactttcgcggatagcgatacgctgcgctgcgatgggttcaggctcattacgaat < 1:271087‑M1/251‑213 (MQ=255) cGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggttcaggctcattacgaattaaatc < 1:492192‑M1/251‑219 (MQ=255) aGCTCCAGGGGAGAACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacagtatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggttcaggctcattacgaattaaatcaatatgc < 2:409515‑M1/251‑226 (MQ=255) gggAGAACGATGCTGCTTgaagcagattgtcctgatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgtcgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgaggaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaagagcgagtgagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggtgcaggctcatgacgaattaaatcaatatgcagtaaacc < 2:93231‑M1/251‑234 (MQ=255) agaACGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatgtagcgcagtgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagcgatttaacgcgggacgttcgctgagagcgatacgctgcgctgcgattggggcaggctcattacgaattaaatcaatattcgagaaaccgtt < 2:236510‑M1/251‑237 (MQ=255) aaCGATGCTGCTTgaagcagatttgccttatagcgcacattatcacgggaaagaacgtgccgaaatatcttaaacagtcgaaatttaacgcattgttgagtaagtaagacaaaaaaagccccaccagaatggcggggcaaagagaatagctagttagctatttaacgcgggacgttcgctgatagcgatacgctgcgctgcgatgggttcaggctcattacgaattaaatcaatatgcagtaaaccgttta < 1:157910‑M1/251‑239 (MQ=255) | CCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCTGCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCATCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTC‑ACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTGCTTTATCAGATCACGCATCACCCGCATATGCGGTGCGGAGTAAGAATAAAACGCCTGATAGCCCGCACAAAGCACGCTGTCTGGCGTCTCCTGCCGAGCGTGCGGGCACAGGCGATGCCAGTCGCACGCCTGGCAGTCACAGCGCGGTTGCGGGTTTTCGCTGCCACACCATTTTTGTAAGGTGGCGTCAAAAAGCTCAATCGAGATACGACTGATATCTGCCCGCACCCAACACTCGAAC > NC_000913/3854911‑3855396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |