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| JC JC | NC_000913 | 3,890,411 | IS1 (–) +9 bp | coding (176‑184/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 47 (0.820) | 45/488 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
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GGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGT > NC_000913/3890161‑3890654 | ggCTATAAGGCTGTTAGCACCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAGAAAAATAGCCTTCCTCTAACAGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAACCAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGCGGTAGGTTTTCTTTACCTGTTGATCTTGCAGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCGTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGgttatt > 2:346981/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |