| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 4,313,864 | Δ16,405 bp | yjdP–rdcB | 18 genes yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4313863 | 0 (0.000) | 58 (1.100) | 52/484 | 0.1 | 100% | intergenic (+64/‑5) | rpiB/yjdP | allose‑6‑phosphate isomerase/ribose‑5‑phosphate isomerase B/protein YjdP |
| ? | NC_000913 | 4330269 = | 0 (0.000) | intergenic (+31/‑233) | rdcB/proP | regulator of diguanylate cyclase RdcB/osmolyte:H(+) symporter ProP | |||||
CGAACCTTATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGACACCATTGGCAATATTCAGCAGGCGATTAATGACGCTTATAACCCTGACCGTGGGCGAGACTATGAAGATTCGCGCGACGACGGCTGGCAGCGTGAAGTGAGCGACGATCGGCGCAGACAATATGACGACCGCCGCCGCCAGTTTGAAGATCGCC > NC_000913/4313613‑4314102 | cGAACCTTATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTCGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCATCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTg < 1:296107/251‑1 (MQ=255) tATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatc < 2:399332‑M1/249‑6 (MQ=255) ttCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatg > 1:150160‑M1/1‑242 (MQ=255) ccGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtg > 1:475889‑M1/1‑240 (MQ=255) 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aCTTTCGCGGCAGCATACCGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTTACGAGTGGTTGGCCTAGAACTGGCAAACATGCTTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCCTCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGtaatacatgtgtgaagtt > 2:452948‑M1/1‑233 (MQ=255) tCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatc > 1:467183‑M1/1‑229 (MQ=255) gcgGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGATAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGATTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcac < 2:299686‑M1/251‑25 (MQ=255) 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gCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattcctta > 2:364673‑M1/1‑148 (MQ=255) gCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaagttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaa < 1:320193‑M1/251‑104 (MQ=255) gtagctgGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGaaatccatgtgtgaagttgatcacaaatttaaacactggtagggtaaaaaggtcattaactgcccaattcaggcgtcaactggtttgattgtacattccttaacc > 1:373251‑M1/4‑146 (MQ=255) 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CGAACCTTATTCCGCGCAACTTTCGCGGCAGCATAACGACACCAACGTGCTGGCTTTTGGTTCACGAGTGGTTGGCCTCGAACTGGCAAAAATGATTGTGGATGCGTGGCTGGGCGCACAGTACGAAGGCGGTCGTCATCAACAACGCGTGGAGGCGATTACGGCAATAGAGCAGCGGAGAAATTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGACACCATTGGCAATATTCAGCAGGCGATTAATGACGCTTATAACCCTGACCGTGGGCGAGACTATGAAGATTCGCGCGACGACGGCTGGCAGCGTGAAGTGAGCGACGATCGGCGCAGACAATATGACGACCGCCGCCGCCAGTTTGAAGATCGCC > NC_000913/4313613‑4314102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |